More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1098 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  90.8 
 
 		 402 aa  756    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  100 
 
 		 402 aa  826    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  57.74 
 
 		 398 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  58.62 
 
 		 381 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  52.94 
 
 		 376 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  54.13 
 
 		 399 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  50.75 
 
 		 399 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  53.32 
 
 		 399 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  51.6 
 
 		 375 aa  391  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  50.5 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  45.19 
 
 		 395 aa  349  5e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  44.5 
 
 		 395 aa  338  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  44.05 
 
 		 406 aa  333  3e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  42.64 
 
 		 403 aa  332  8e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  44.27 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  42.51 
 
 		 403 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  42.25 
 
 		 403 aa  316  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  41.82 
 
 		 387 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  38.42 
 
 		 390 aa  264  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  36.49 
 
 		 379 aa  252  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  37.84 
 
 		 373 aa  242  9e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  38.12 
 
 		 389 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  37.57 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  37.14 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  37.3 
 
 		 373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  38.13 
 
 		 369 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  36.1 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  36.1 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  36.36 
 
 		 391 aa  233  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  36.1 
 
 		 391 aa  234  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  36.36 
 
 		 391 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  36.02 
 
 		 391 aa  234  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  36.1 
 
 		 391 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  34.09 
 
 		 434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  34.92 
 
 		 378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  35.4 
 
 		 421 aa  232  8.000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  36.51 
 
 		 391 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  35.22 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  36.1 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  35.85 
 
 		 392 aa  231  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  35.41 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  37.21 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  35.6 
 
 		 380 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  35.85 
 
 		 373 aa  225  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  34.91 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  34.99 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  35.64 
 
 		 390 aa  223  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  35.22 
 
 		 408 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  34.69 
 
 		 398 aa  219  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  34.04 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  33.87 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  35.14 
 
 		 441 aa  217  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  35.26 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  34.86 
 
 		 371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  35 
 
 		 386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  34.83 
 
 		 377 aa  216  8e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  34.99 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  35.54 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  33.78 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3857  alanine racemase  37.47 
 
 		 372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859951  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  32.43 
 
 		 375 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  33.33 
 
 		 395 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  33.68 
 
 		 379 aa  211  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  33.68 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  31.72 
 
 		 433 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  33.06 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  34.68 
 
 		 370 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  35.82 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0280  alanine racemase region  34.27 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0768995 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  31.35 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  33.33 
 
 		 395 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  32.72 
 
 		 384 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  36.1 
 
 		 369 aa  206  8e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  31.89 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  32.61 
 
 		 380 aa  205  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  33.5 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  34.5 
 
 		 402 aa  202  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  34.69 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  33.33 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  34.52 
 
 		 378 aa  199  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2554  alanine racemase  33.33 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  32.97 
 
 		 376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  33.6 
 
 		 851 aa  196  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1484  alanine racemase  35.36 
 
 		 390 aa  195  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159297  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  35.54 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  33.08 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  33.6 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2737  alanine racemase  32.71 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115785  hitchhiker  0.00850953 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3073  alanine racemase  33.25 
 
 		 378 aa  194  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.235998  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0627  alanine racemase  33.07 
 
 		 410 aa  193  5e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00334248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  33.33 
 
 		 376 aa  193  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  35.01 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  34.75 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  35.28 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  35.01 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  32.55 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2180  alanine racemase  31.71 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  35.01 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  32.55 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2896  alanine racemase  34.96 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>