More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1077 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1077  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 124 aa  249  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19521  30S ribosomal protein S12  99.19 
 
 		 124 aa  248  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0323  30S ribosomal protein S12  91.94 
 
 		 124 aa  236  6.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.436822  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2019  30S ribosomal protein S12  91.94 
 
 		 124 aa  235  1e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16341  30S ribosomal protein S12  93.5 
 
 		 123 aa  231  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.369961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23611  30S ribosomal protein S12  89.52 
 
 		 125 aa  226  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.436727 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17141  30S ribosomal protein S12  88.71 
 
 		 124 aa  225  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.387317  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1603  30S ribosomal protein S12  89.52 
 
 		 124 aa  225  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17021  30S ribosomal protein S12  88.71 
 
 		 124 aa  225  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16911  30S ribosomal protein S12  89.52 
 
 		 125 aa  225  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  86.99 
 
 		 136 aa  224  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  86.99 
 
 		 124 aa  223  9e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  85.48 
 
 		 127 aa  221  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  84.68 
 
 		 127 aa  219  7e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 124 aa  219  9e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  84.68 
 
 		 125 aa  218  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  84.68 
 
 		 125 aa  218  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 123 aa  216  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  207  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 126 aa  206  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 126 aa  206  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 126 aa  206  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 126 aa  206  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3302  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 125 aa  206  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000119116  hitchhiker  0.00857233 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3024  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 125 aa  206  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000203236  decreased coverage  0.00243586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2955  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 125 aa  206  9e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0353473  hitchhiker  0.000186229 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 126 aa  206  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 125 aa  205  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 126 aa  205  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 126 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 126 aa  206  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 125 aa  206  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 126 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 126 aa  206  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 126 aa  206  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 126 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 		 128 aa  205  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0451  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 127 aa  205  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0540  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 128 aa  204  2e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 126 aa  205  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  205  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1444  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 128 aa  204  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 126 aa  205  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0318  ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 125 aa  205  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000292606  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 126 aa  205  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0511  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 128 aa  204  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 125 aa  205  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 126 aa  205  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 126 aa  205  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  205  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1313  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 127 aa  205  2e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00377072  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3327  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 125 aa  204  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 126 aa  204  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1660  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 124 aa  204  3e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.106297  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0386  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 125 aa  204  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0122913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0400  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 125 aa  204  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000378884  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3185  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 125 aa  204  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0661629  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0251  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 125 aa  203  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0273  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 125 aa  203  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0102222  hitchhiker  0.00000133028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0268  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 125 aa  203  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000012453  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0198  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 125 aa  203  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000216597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 125 aa  203  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 124 aa  202  9e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 124 aa  202  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 135 aa  202  9e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1897  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113502  normal  0.324769 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 125 aa  202  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_007969  Pcryo_2187  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000672266  normal  0.0265681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3343  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 125 aa  202  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00659827  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0048  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 126 aa  201  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4920  ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 125 aa  202  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0314  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 125 aa  201  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.4670400000000002e-24  hitchhiker  0.000521064 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 136 aa  201  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  201  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 128 aa  201  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0045  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 126 aa  201  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000913228  hitchhiker  7.76086e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  201  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 137 aa  201  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  201  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0389  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 126 aa  200  6e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0364  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 126 aa  200  6e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 129 aa  200  6e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06190  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  199  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529309  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  199  8e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08790  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  199  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.762272  normal  0.0106283 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  199  8e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1259  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 125 aa  199  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0832  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  199  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2377  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  199  9e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00376879  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1863  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  199  9e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000968975  normal  0.252117 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0762  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 125 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 135 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2329  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000396371  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0355  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2234  30S ribosomal protein S12  80 
 
 		 135 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000995166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>