More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1068 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  100 
 
 		 195 aa  397  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  96.92 
 
 		 195 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23711  ribonuclease HII  61.08 
 
 		 200 aa  230  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.108484 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16251  ribonuclease HII  61.08 
 
 		 196 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2028  ribonuclease HII  58.25 
 
 		 199 aa  209  3e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0314  ribonuclease HII  60 
 
 		 199 aa  206  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  50.53 
 
 		 209 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1594  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17051  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 205 aa  175  3e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.492555  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16931  ribonuclease HII  52.46 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  48.66 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  51.09 
 
 		 211 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  47.85 
 
 		 221 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 215 aa  155  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  46.7 
 
 		 277 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  45.05 
 
 		 191 aa  147  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  45.45 
 
 		 197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  43.65 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  45.6 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  44.51 
 
 		 212 aa  141  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  43.85 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  47.03 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  43.78 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  42.02 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  41.53 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  40 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  42.62 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  44.32 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  40 
 
 		 272 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  43.72 
 
 		 198 aa  138  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  42.62 
 
 		 227 aa  138  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  43.17 
 
 		 206 aa  138  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  46.15 
 
 		 199 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 229 aa  138  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  43.24 
 
 		 224 aa  138  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  44.51 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  43.55 
 
 		 198 aa  137  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  43.68 
 
 		 196 aa  137  7.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  44.32 
 
 		 201 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  42.35 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  42.62 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  44.02 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 191 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  41.94 
 
 		 206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  41.62 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  44.51 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  44.51 
 
 		 198 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  44.51 
 
 		 198 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  44.51 
 
 		 198 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  43.85 
 
 		 191 aa  134  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  38.89 
 
 		 220 aa  134  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  44.51 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  44.51 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  45.11 
 
 		 210 aa  133  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  40.33 
 
 		 198 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  43.55 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0404  ribonuclease HII  40.33 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.505687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  43.55 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  43.55 
 
 		 198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  42.39 
 
 		 257 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  41.85 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  41.21 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  43.78 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  43.41 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  43.41 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  43.48 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  43.41 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  41.3 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  43.41 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  43.41 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  43.41 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  43.72 
 
 		 203 aa  131  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  44.27 
 
 		 222 aa  131  5e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  45.05 
 
 		 214 aa  131  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 209 aa  131  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1185  hypothetical protein  45.74 
 
 		 194 aa  131  6e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.130682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  43.24 
 
 		 208 aa  131  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  43.41 
 
 		 198 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  43.41 
 
 		 198 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  43.41 
 
 		 198 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  44.81 
 
 		 235 aa  130  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  44.2 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  41.36 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  41.76 
 
 		 268 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2443  ribonuclease HII  42.47 
 
 		 193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0013683  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  43.17 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  40.11 
 
 		 212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  43.72 
 
 		 190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  42.16 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  40.64 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  43.55 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  43.55 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  42.16 
 
 		 216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  40.32 
 
 		 213 aa  128  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  41.76 
 
 		 256 aa  128  6e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 205 aa  128  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  44.09 
 
 		 267 aa  127  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>