More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1067 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_16811  ribonuclease E/G  56.64 
 
 		 608 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1067  RNAse E  100 
 
 		 640 aa  1284    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.232877  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2029  ribonuclease E and G  64.37 
 
 		 646 aa  713    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0313  RNAse E  64.23 
 
 		 646 aa  726    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1593  ribonuclease  59.52 
 
 		 605 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.435522  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16241  ribonuclease E/G  59.8 
 
 		 624 aa  698    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16921  ribonuclease E/G  54.88 
 
 		 602 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17041  ribonuclease E/G  54.08 
 
 		 606 aa  647    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.925066  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19421  ribonuclease E/G  97.14 
 
 		 640 aa  1224    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.839153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23721  ribonuclease E/G  62.86 
 
 		 647 aa  707    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0483  ribonuclease  50.8 
 
 		 682 aa  587  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.582828  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1281  ribonuclease E and G  68.89 
 
 		 687 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000695712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0668  ribonuclease, Rne/Rng family  67.65 
 
 		 713 aa  580  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1064  ribonuclease, Rne/Rng family  48.93 
 
 		 653 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0042  ribonuclease, Rne/Rng family  53.96 
 
 		 645 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754542 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1093  ribonuclease, Rne/Rng family  48.93 
 
 		 653 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3404  ribonuclease, Rne/Rng family  66.75 
 
 		 669 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0878  ribonuclease  65.76 
 
 		 808 aa  561  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  41.93 
 
 		 559 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  44.03 
 
 		 564 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  39.16 
 
 		 411 aa  281  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  40.7 
 
 		 562 aa  278  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  40.26 
 
 		 702 aa  273  7e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  39.84 
 
 		 496 aa  272  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  39.8 
 
 		 908 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  39.85 
 
 		 1007 aa  272  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  38.52 
 
 		 1041 aa  266  8e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  37.08 
 
 		 476 aa  266  8e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  39.11 
 
 		 543 aa  266  8.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  37.25 
 
 		 494 aa  266  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  44.72 
 
 		 416 aa  265  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  38.89 
 
 		 1093 aa  261  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  40.65 
 
 		 571 aa  261  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  39.21 
 
 		 1080 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  38.94 
 
 		 1427 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  37.53 
 
 		 952 aa  258  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  39.43 
 
 		 990 aa  258  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  38.86 
 
 		 1334 aa  257  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  38.4 
 
 		 974 aa  256  7e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  36.45 
 
 		 483 aa  256  1.0000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  39.85 
 
 		 1194 aa  255  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  39.32 
 
 		 922 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  38.46 
 
 		 1048 aa  254  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  37.11 
 
 		 1022 aa  254  3e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  38.07 
 
 		 717 aa  254  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  36.04 
 
 		 1093 aa  253  7e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  39.6 
 
 		 497 aa  252  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  39.44 
 
 		 503 aa  251  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  38.71 
 
 		 1012 aa  251  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  37.86 
 
 		 959 aa  250  5e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  36.95 
 
 		 1117 aa  250  5e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  37.23 
 
 		 944 aa  250  5e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  38.56 
 
 		 1057 aa  250  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  38.67 
 
 		 1151 aa  249  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  36.76 
 
 		 483 aa  249  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2185  ribonuclease E  38.56 
 
 		 1073 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0610467  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  38.27 
 
 		 1123 aa  248  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  38.87 
 
 		 1058 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14810  Ribonuclease E  38.56 
 
 		 1139 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4166  RNAse E  38.56 
 
 		 1082 aa  249  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000306864  normal  0.124166 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  36.93 
 
 		 1040 aa  248  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  37.34 
 
 		 492 aa  248  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  35.66 
 
 		 1265 aa  247  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  36.9 
 
 		 497 aa  247  4e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  37.68 
 
 		 636 aa  248  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  35.77 
 
 		 515 aa  247  4e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  38.06 
 
 		 1128 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  37.37 
 
 		 497 aa  247  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  36.1 
 
 		 512 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1516  ribonuclease  37.87 
 
 		 1072 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00855049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1638  ribonuclease E and G  38.31 
 
 		 1120 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  38.34 
 
 		 1024 aa  246  6.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1481  ribonuclease  37.87 
 
 		 1086 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00984617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  37.5 
 
 		 1070 aa  246  8e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  37.53 
 
 		 489 aa  246  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  38.67 
 
 		 1113 aa  246  9e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  36.93 
 
 		 1244 aa  246  9e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3809  ribonuclease  37.87 
 
 		 1090 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000518974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  33.41 
 
 		 525 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  36.36 
 
 		 492 aa  245  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4433  ribonuclease, Rne/Rng family  35.75 
 
 		 520 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.320456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1905  ribonuclease, Rne/Rng family  37.87 
 
 		 1091 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.879394  unclonable  0.000000947805 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  36.87 
 
 		 489 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  36.87 
 
 		 489 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  35.15 
 
 		 496 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  35.15 
 
 		 496 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  36.88 
 
 		 1043 aa  242  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1764  ribonuclease  36.63 
 
 		 465 aa  240  5e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3527  ribonuclease  36.5 
 
 		 515 aa  240  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255196  normal  0.0164409 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  36.93 
 
 		 1091 aa  238  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  34.96 
 
 		 961 aa  239  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  40.47 
 
 		 493 aa  237  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1478  ribonuclease, Rne/Rng family  34.81 
 
 		 514 aa  237  5.0000000000000005e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  37.08 
 
 		 487 aa  236  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  36.69 
 
 		 495 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  39.68 
 
 		 1018 aa  235  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2137  ribonuclease  41.27 
 
 		 482 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  36.43 
 
 		 495 aa  234  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3196  ribonuclease G  36.62 
 
 		 517 aa  234  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14130  ribonuclease, Rne/Rng family  37.26 
 
 		 489 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000124696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>