72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0878 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_17331  integral membrane protein  98.92 
 
 
369 aa  722    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.07903  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0878  PIN domain superfamily protein  100 
 
 
369 aa  726    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.412243  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20011  integral membrane protein  68.41 
 
 
389 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192672 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13601  integral membrane protein  66.57 
 
 
371 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.729181  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14981  integral membrane protein  62.87 
 
 
369 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1409  PIN domain superfamily protein  63.14 
 
 
369 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15111  integral membrane protein  62.33 
 
 
369 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.361887  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0842  nucleotide binding protein, PINc  61.73 
 
 
385 aa  442  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.214431  normal  0.01039 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14731  integral membrane protein  61.79 
 
 
369 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.961128  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1547  nucleotide binding protein, PINc  60.98 
 
 
388 aa  424  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.111102  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2383  nucleotide binding protein, PINc  51.96 
 
 
383 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1851  PilT protein domain protein  49.15 
 
 
359 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165199  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2222  PilT protein-like  48.58 
 
 
358 aa  350  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4460  PilT protein domain protein  48.86 
 
 
360 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4268  PilT protein domain-containing protein  48.01 
 
 
358 aa  349  4e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.040207  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1195  PilT protein-like  46.31 
 
 
359 aa  341  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3506  PilT protein domain protein  47.67 
 
 
360 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal  0.104798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2600  PilT protein domain protein  47.67 
 
 
360 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0174  PilT protein domain protein  36.51 
 
 
367 aa  216  4e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0085  PilT protein domain protein  35.22 
 
 
364 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0127482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2488  PilT protein-like  38.8 
 
 
383 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.0444425 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0081  PilT protein domain protein  34.25 
 
 
364 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0838  PilT domain-containing protein  37.58 
 
 
367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000323541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2427  PIN/TRAM domain-containing protein  35.89 
 
 
368 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2736  PilT protein domain protein  36.82 
 
 
363 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000848618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5221  hypothetical protein  35.26 
 
 
367 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00102382  unclonable  1.43587e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0260  PilT protein domain protein  35.79 
 
 
383 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000167901  normal  0.0149964 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1561  PilT protein domain protein  38.44 
 
 
357 aa  189  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0084  hypothetical protein  34.55 
 
 
369 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0083  hypothetical protein  34.55 
 
 
369 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0080  hypothetical protein  34.55 
 
 
369 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0084  hypothetical protein  34.55 
 
 
369 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0081  hypothetical protein  34.55 
 
 
369 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0079  PilT domain-containing protein  35.58 
 
 
370 aa  186  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0393  PilT protein domain protein  35.74 
 
 
388 aa  186  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182305  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0079  PilT domain-containing protein  34.45 
 
 
367 aa  186  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0186  PilT domain-containing protein  34.12 
 
 
380 aa  185  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0442376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0105  hypothetical protein  34.88 
 
 
369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2740  PIN/TRAM domain-containing protein  34.5 
 
 
368 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0185  PilT domain-containing protein  35.78 
 
 
371 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000117639  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0165  PilT protein domain protein  34.65 
 
 
366 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0341  PilT protein domain protein  35.16 
 
 
346 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220922  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1002  PilT protein domain protein  45.6 
 
 
377 aa  180  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000369877  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00910  PilT protein domain protein  34.59 
 
 
364 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000274223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0185  PilT domain-containing protein  36.76 
 
 
385 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000320699  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0115  PilT protein domain protein  44.95 
 
 
257 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.673954  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0302  PilT domain-containing protein  35.28 
 
 
380 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2362  pili retraction protein PilT  41.06 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.36366  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3656  PilT domain-containing protein  37.54 
 
 
346 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367693  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0549  PilT domain-containing protein  31.77 
 
 
357 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0563  PilT domain-containing protein  31.77 
 
 
357 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1733  PilT domain-containing protein  37.16 
 
 
361 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.147599 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0400  PilT protein domain protein  38.51 
 
 
369 aa  168  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000234721  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0167  PilT domain-containing protein  34.11 
 
 
358 aa  168  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1477  PilT protein domain protein  42.64 
 
 
269 aa  167  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0506591  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2358  integral membrane protein  37.75 
 
 
361 aa  166  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3254  PilT protein domain protein  36.79 
 
 
366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0079  PilT domain-containing protein  33.02 
 
 
385 aa  160  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430433  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1657  PilT domain-containing protein  35.27 
 
 
355 aa  155  9e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145178  normal  0.591632 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2018  PilT domain-containing protein  36.18 
 
 
364 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0189  PilT protein-like  33.96 
 
 
384 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.919011  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2177  PilT protein domain protein  31.95 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0095  PilT protein domain protein  43.29 
 
 
168 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33572e-62 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0998  PilT protein-like protein  40.72 
 
 
361 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00567105  normal  0.0135719 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1515  PilT protein domain protein  36.46 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2116  PilT domain-containing protein  35.79 
 
 
336 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1298  PilT protein domain protein  39.7 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  32.86 
 
 
630 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  35.04 
 
 
634 aa  45.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  31.03 
 
 
630 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1392  ATPase  27.55 
 
 
630 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  31.78 
 
 
633 aa  42.7  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>