More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0872 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0872  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 348 aa  711    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.658926  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17261  D-alanyl-alanine synthetase A  95.98 
 
 		 348 aa  690    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.82734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13541  D-alanine--D-alanine ligase  54.52 
 
 		 353 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.337392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  49.14 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1541  D-alanyl-alanine synthetase A  48.58 
 
 		 350 aa  374  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14921  D-alanyl-alanine synthetase A  47.99 
 
 		 355 aa  355  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19931  D-alanyl-alanine synthetase A  48.73 
 
 		 353 aa  352  4e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.115642 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15051  D-alanyl-alanine synthetase A  47.7 
 
 		 355 aa  352  5.9999999999999994e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.442673  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1402  D-alanyl-alanine synthetase A  47.56 
 
 		 355 aa  345  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  48.23 
 
 		 366 aa  341  9e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  47.81 
 
 		 351 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14671  D-alanyl-alanine synthetase A  46.26 
 
 		 355 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0791512  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  47.52 
 
 		 351 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  46.67 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  48.71 
 
 		 351 aa  328  7e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1199  D-alanyl-alanine synthetase A  48.7 
 
 		 349 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  47.55 
 
 		 352 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2375  D-alanyl-alanine synthetase A  49.28 
 
 		 347 aa  318  7.999999999999999e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.875604  normal  0.964847 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  43.05 
 
 		 383 aa  297  1e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  45.61 
 
 		 361 aa  296  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  44.01 
 
 		 361 aa  292  6e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  43.1 
 
 		 362 aa  281  9e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  39.84 
 
 		 371 aa  280  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  41.96 
 
 		 376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  40 
 
 		 366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  40.62 
 
 		 366 aa  273  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  41.74 
 
 		 365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  42.66 
 
 		 361 aa  272  6e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  39.3 
 
 		 370 aa  272  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  42.66 
 
 		 361 aa  272  7e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  42.06 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  42.66 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  42.66 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  42.37 
 
 		 361 aa  270  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  42.05 
 
 		 362 aa  269  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  42.45 
 
 		 357 aa  268  8.999999999999999e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  42.49 
 
 		 362 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  40.95 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  40.95 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  42.13 
 
 		 359 aa  266  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  39.06 
 
 		 367 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  40.95 
 
 		 364 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  39.12 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  40.62 
 
 		 343 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  38.29 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  41.04 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  40.43 
 
 		 376 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  39.22 
 
 		 366 aa  262  6e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  38.38 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  38.38 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  38.38 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  38.38 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  38.38 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  38.38 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  38.38 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  38.38 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  41.53 
 
 		 361 aa  259  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  40.96 
 
 		 361 aa  257  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  42.44 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  41.01 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  37.71 
 
 		 364 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  37.71 
 
 		 364 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  37.71 
 
 		 364 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  37.71 
 
 		 364 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  37.71 
 
 		 364 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  39.94 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  38.94 
 
 		 375 aa  250  3e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  38.29 
 
 		 369 aa  249  5e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  37.23 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  41.36 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  37.99 
 
 		 363 aa  240  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  37.5 
 
 		 363 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  36.93 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  38.66 
 
 		 358 aa  232  7.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  34.9 
 
 		 360 aa  229  4e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1544  D-alanyl-alanine synthetase A  37.14 
 
 		 348 aa  229  5e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08790  D-alanine--D-alanine ligase  35.16 
 
 		 379 aa  227  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0347411  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  34.78 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  36.69 
 
 		 360 aa  226  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  36.31 
 
 		 360 aa  226  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  35.1 
 
 		 369 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1427  D-alanyl-alanine synthetase A  36.29 
 
 		 373 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0387  D-alanyl-alanine synthetase A  36.29 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0661  D-alanine/D-alanine ligase  36.89 
 
 		 324 aa  223  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.435945  normal  0.336706 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  35.93 
 
 		 360 aa  222  7e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0337  D-alanine/D-alanine ligase  36.76 
 
 		 322 aa  222  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  35.46 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3672  D-alanine--D-alanine ligase  39.33 
 
 		 364 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  34.95 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  37.91 
 
 		 371 aa  220  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  35.23 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  35.03 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1331  D-alanyl-alanine synthetase A  33.7 
 
 		 361 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  35.71 
 
 		 363 aa  219  6e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  38.03 
 
 		 368 aa  219  6e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  34.05 
 
 		 384 aa  219  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  35.41 
 
 		 373 aa  219  6e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  37.12 
 
 		 386 aa  219  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1490  D-alanyl-alanine synthetase A  35.83 
 
 		 372 aa  219  7.999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0922  D-alanyl-alanine synthetase A  35.65 
 
 		 382 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>