More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0864 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_13451  dihydrolipoamide dehydrogenase  80.42 
 
 		 481 aa  816    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0908915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19781  dihydrolipoamide dehydrogenase  79.92 
 
 		 489 aa  805    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 480 aa  973    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1530  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.87 
 
 		 480 aa  801    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.411134  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0869  dihydrolipoamide dehydrogenase  80.54 
 
 		 480 aa  813    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.238333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.37 
 
 		 479 aa  774    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1198  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.83 
 
 		 479 aa  698    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14831  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.16 
 
 		 479 aa  771    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.509805  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14971  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.57 
 
 		 479 aa  776    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.223464  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  99.58 
 
 		 480 aa  968    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.57 
 
 		 479 aa  778    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5041  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.68 
 
 		 477 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3920  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.92 
 
 		 476 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3968  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.92 
 
 		 476 aa  601  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1927  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.91 
 
 		 475 aa  586  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0099  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.7 
 
 		 476 aa  578  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0247  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.75 
 
 		 478 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0691299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3171  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.31 
 
 		 476 aa  577  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30113  lipoamide dehydrogenase  52.82 
 
 		 543 aa  510  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15203  predicted protein  55.41 
 
 		 462 aa  494  9.999999999999999e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000969694  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.23 
 
 		 463 aa  295  9e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.56 
 
 		 458 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.15 
 
 		 475 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.63 
 
 		 465 aa  286  5e-76  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.17 
 
 		 470 aa  285  9e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.42 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.21 
 
 		 467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.34 
 
 		 467 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.37 
 
 		 470 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.78 
 
 		 466 aa  278  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.48 
 
 		 585 aa  277  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.34 
 
 		 466 aa  276  8e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.08 
 
 		 469 aa  275  9e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.76 
 
 		 458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.87 
 
 		 465 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.23 
 
 		 467 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.67 
 
 		 462 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.89 
 
 		 470 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.7 
 
 		 466 aa  273  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.19 
 
 		 462 aa  273  7e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.91 
 
 		 465 aa  272  8.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.2 
 
 		 468 aa  272  9e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.11 
 
 		 470 aa  272  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.11 
 
 		 470 aa  272  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.14 
 
 		 479 aa  272  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.11 
 
 		 470 aa  272  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.11 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.11 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.11 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.11 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.11 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.11 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.33 
 
 		 465 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.2 
 
 		 478 aa  270  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.69 
 
 		 467 aa  270  4e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.23 
 
 		 463 aa  270  5e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.61 
 
 		 465 aa  269  8e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.92 
 
 		 593 aa  269  8.999999999999999e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.27 
 
 		 462 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.16 
 
 		 468 aa  268  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.99 
 
 		 478 aa  269  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.56 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.27 
 
 		 462 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.39 
 
 		 466 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.95 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.22 
 
 		 466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.15 
 
 		 476 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.98 
 
 		 466 aa  266  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.46 
 
 		 468 aa  266  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.62 
 
 		 470 aa  266  5.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.36 
 
 		 476 aa  266  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.67 
 
 		 459 aa  266  7e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.68 
 
 		 470 aa  266  8e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.12 
 
 		 470 aa  266  8.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.55 
 
 		 478 aa  266  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.55 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.85 
 
 		 463 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.15 
 
 		 476 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.15 
 
 		 476 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.1 
 
 		 470 aa  264  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.54 
 
 		 467 aa  265  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  35 
 
 		 475 aa  265  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.15 
 
 		 476 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.36 
 
 		 474 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.35 
 
 		 478 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.51 
 
 		 479 aa  265  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  35.17 
 
 		 468 aa  264  3e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.95 
 
 		 476 aa  264  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.16 
 
 		 479 aa  264  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.15 
 
 		 476 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.54 
 
 		 467 aa  263  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.62 
 
 		 492 aa  263  6.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.09 
 
 		 481 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.47 
 
 		 473 aa  262  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.92 
 
 		 466 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.95 
 
 		 476 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.95 
 
 		 476 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.95 
 
 		 476 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.36 
 
 		 476 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.48 
 
 		 463 aa  262  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>