More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0848 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 313 aa  639    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  98.72 
 
 		 313 aa  628  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1511  GTP-binding protein Era  65.13 
 
 		 319 aa  414  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  62.95 
 
 		 311 aa  413  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  61.97 
 
 		 343 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  60.83 
 
 		 314 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1377  GTP-binding protein Era  59.93 
 
 		 303 aa  352  4e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0974001  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14421  GTP-binding protein Era  58.94 
 
 		 303 aa  346  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  56.29 
 
 		 303 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  56.95 
 
 		 303 aa  332  6e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  52.79 
 
 		 311 aa  329  3e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  52.29 
 
 		 314 aa  325  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  51.96 
 
 		 314 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  51.83 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  53.82 
 
 		 337 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  54.67 
 
 		 315 aa  311  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  53.16 
 
 		 318 aa  303  3.0000000000000004e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  52.13 
 
 		 318 aa  299  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 		 299 aa  282  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 		 299 aa  282  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  46.43 
 
 		 302 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  46.05 
 
 		 302 aa  278  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  45.13 
 
 		 302 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  46.43 
 
 		 301 aa  276  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 299 aa  275  6e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  46.89 
 
 		 301 aa  275  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  46.75 
 
 		 301 aa  275  8e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  44.26 
 
 		 303 aa  274  2.0000000000000002e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  45.98 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  46.43 
 
 		 301 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  46.43 
 
 		 301 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 		 301 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 		 301 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 		 301 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 		 301 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 		 301 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  44.84 
 
 		 303 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  46.36 
 
 		 294 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  46.67 
 
 		 299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  47.54 
 
 		 301 aa  263  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  46.2 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  44.63 
 
 		 303 aa  263  4e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  43.89 
 
 		 301 aa  262  4.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  44.19 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 		 297 aa  259  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  44.81 
 
 		 300 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  44.01 
 
 		 300 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  43.71 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  43.28 
 
 		 299 aa  253  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  46.69 
 
 		 297 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  42.39 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  43.51 
 
 		 298 aa  249  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  43.52 
 
 		 298 aa  249  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  42.53 
 
 		 305 aa  249  5e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  43.79 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  41.42 
 
 		 297 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  41.04 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  40.13 
 
 		 303 aa  242  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  41.1 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  42.43 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  43.32 
 
 		 300 aa  239  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  41.83 
 
 		 489 aa  239  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  42.11 
 
 		 296 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  45.08 
 
 		 300 aa  239  5e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  45.08 
 
 		 301 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  42.72 
 
 		 301 aa  238  9e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  44.67 
 
 		 451 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  43.71 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  43.19 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  43.38 
 
 		 301 aa  236  5.0000000000000005e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  40.2 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  38.21 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  42.52 
 
 		 299 aa  233  5e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 		 449 aa  232  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  42.67 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  41.53 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  40.19 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  39.8 
 
 		 298 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  40.65 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  41.5 
 
 		 468 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11760  GTP-binding protein Era  38.56 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.28121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  39.34 
 
 		 324 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  39.54 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  40.73 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  39.16 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  40.53 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  39.14 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  37.7 
 
 		 300 aa  219  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  38.91 
 
 		 296 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2758  GTP-binding protein Era  36.25 
 
 		 318 aa  215  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0588408  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0507  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000333853  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  37.25 
 
 		 299 aa  212  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  38.44 
 
 		 314 aa  212  7e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1743  GTP-binding protein Era  40.13 
 
 		 293 aa  212  7e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  39.61 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  37.13 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  36.93 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12310  GTP-binding protein Era  36.94 
 
 		 321 aa  209  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>