More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0788 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 779 aa  1535    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  96.79 
 
 		 779 aa  1461    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  41.26 
 
 		 780 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  38.35 
 
 		 865 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  33.46 
 
 		 1676 aa  386  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  41.84 
 
 		 580 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  38.14 
 
 		 661 aa  379  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  35.84 
 
 		 704 aa  356  7.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  36.23 
 
 		 653 aa  345  2e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  33.49 
 
 		 631 aa  337  3.9999999999999995e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.99 
 
 		 875 aa  260  7e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  31.01 
 
 		 594 aa  125  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 685 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 739 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.7 
 
 		 909 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 		 323 aa  113  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 		 362 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  31.98 
 
 		 594 aa  113  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  31.47 
 
 		 816 aa  112  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 		 612 aa  110  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.25 
 
 		 402 aa  109  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 		 637 aa  108  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 		 681 aa  106  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 750 aa  106  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  29.07 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  26.79 
 
 		 414 aa  101  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 583 aa  101  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  29.75 
 
 		 441 aa  100  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 390 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.04 
 
 		 603 aa  96.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 878 aa  94  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.3 
 
 		 810 aa  94  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 3560 aa  92.8  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3000  Methyltransferase type 12  25.66 
 
 		 370 aa  92.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  26.79 
 
 		 434 aa  91.7  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.98 
 
 		 725 aa  91.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  28.5 
 
 		 399 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3879  Methyltransferase type 12  32.8 
 
 		 359 aa  89.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4260  methyltransferase type 12  28.06 
 
 		 441 aa  89.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  35.12 
 
 		 529 aa  88.2  5e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  25.81 
 
 		 626 aa  88.2  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 614 aa  88.2  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3967  Methyltransferase type 12  32.26 
 
 		 359 aa  87.4  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000336938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.2 
 
 		 818 aa  87.8  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1065  methyltransferase type 12  32.79 
 
 		 360 aa  87.4  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.84 
 
 		 1022 aa  87.4  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  25.27 
 
 		 395 aa  87  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  30.77 
 
 		 425 aa  87  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  29.19 
 
 		 403 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 444 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  26.79 
 
 		 837 aa  86.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  32.81 
 
 		 437 aa  86.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 		 235 aa  85.9  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  29.63 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  24.6 
 
 		 626 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 3145 aa  85.5  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  25.4 
 
 		 626 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  25.4 
 
 		 614 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  25.4 
 
 		 614 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 614 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0481  hypothetical protein  28.06 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.874719  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 3035 aa  84.3  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12103  hypothetical protein  26.48 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00110715  normal  0.946541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.76 
 
 		 784 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 1056 aa  84.3  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  29.95 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  29.95 
 
 		 400 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  25.49 
 
 		 400 aa  84  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 4489 aa  81.6  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 649 aa  81.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1047  hypothetical protein  23.05 
 
 		 360 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  25.82 
 
 		 407 aa  79.7  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.98 
 
 		 632 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  31.58 
 
 		 514 aa  79  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  28.08 
 
 		 936 aa  78.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.64 
 
 		 622 aa  78.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 615 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.07 
 
 		 988 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.41 
 
 		 795 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  25.11 
 
 		 715 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 1827 aa  77  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  21.04 
 
 		 447 aa  77.4  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.19 
 
 		 764 aa  76.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 		 1094 aa  76.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  24.63 
 
 		 440 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 		 1737 aa  75.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 670 aa  75.1  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 828 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27.04 
 
 		 887 aa  74.7  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  27.66 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 		 542 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 614 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 		 833 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 502 aa  73.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  24.38 
 
 		 714 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  27.78 
 
 		 653 aa  72.4  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 602 aa  72  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 636 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 653 aa  72.4  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  28.05 
 
 		 467 aa  72  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>