87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0777 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  100 
 
 		 414 aa  841    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  71.7 
 
 		 415 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  46.12 
 
 		 515 aa  349  5e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  44.9 
 
 		 515 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  39.69 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  40.76 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  40.86 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  40.34 
 
 		 514 aa  282  7.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  38.06 
 
 		 524 aa  276  5e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  37.56 
 
 		 437 aa  260  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  41.38 
 
 		 415 aa  259  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  33.42 
 
 		 528 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  29.2 
 
 		 555 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  30.75 
 
 		 510 aa  160  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  31.9 
 
 		 531 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  31.33 
 
 		 518 aa  155  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  29.85 
 
 		 513 aa  155  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  29.23 
 
 		 543 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  29.13 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  30.54 
 
 		 500 aa  146  6e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  27.66 
 
 		 561 aa  146  7.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  28.14 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  31.22 
 
 		 371 aa  136  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  34.05 
 
 		 333 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  28.18 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  32.78 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  32.94 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  32.38 
 
 		 332 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  27.47 
 
 		 328 aa  123  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  27.71 
 
 		 328 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  25.64 
 
 		 384 aa  122  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  27.75 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  29.25 
 
 		 475 aa  116  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  29.29 
 
 		 384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  29.79 
 
 		 385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  28.64 
 
 		 450 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  26.9 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  28.09 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  26.39 
 
 		 369 aa  99.8  9e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  25.78 
 
 		 531 aa  97.1  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  26.23 
 
 		 639 aa  96.7  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  25.06 
 
 		 491 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  25.63 
 
 		 449 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  26.75 
 
 		 531 aa  94.4  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  25.92 
 
 		 571 aa  86.7  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  27.12 
 
 		 561 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  25.58 
 
 		 574 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  25.88 
 
 		 542 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  26.52 
 
 		 539 aa  83.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  25.65 
 
 		 548 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  22.71 
 
 		 581 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  24.49 
 
 		 543 aa  80.9  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  24.18 
 
 		 529 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  24.47 
 
 		 550 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  24.28 
 
 		 578 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  23.84 
 
 		 533 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  26.48 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  25.43 
 
 		 518 aa  76.6  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  24.7 
 
 		 551 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  22.65 
 
 		 544 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  22.73 
 
 		 563 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  23.62 
 
 		 600 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  25.37 
 
 		 530 aa  70.1  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  30.97 
 
 		 658 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  24 
 
 		 550 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  24.83 
 
 		 581 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  24.83 
 
 		 581 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  20.42 
 
 		 589 aa  63.2  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  22.59 
 
 		 591 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  31.11 
 
 		 572 aa  59.7  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  30.95 
 
 		 632 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  30.95 
 
 		 645 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  29.87 
 
 		 624 aa  56.6  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  31.16 
 
 		 622 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  24.82 
 
 		 604 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  28.49 
 
 		 643 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  36.78 
 
 		 641 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  32.54 
 
 		 666 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  32.54 
 
 		 666 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  23.49 
 
 		 606 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  64.29 
 
 		 188 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  28.47 
 
 		 527 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  20.72 
 
 		 508 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  27.21 
 
 		 586 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  27.21 
 
 		 586 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  33.33 
 
 		 568 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  26.06 
 
 		 593 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>