76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0718 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0718  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbC  100 
 
 		 370 aa  751    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15551  hypothetical protein  99.73 
 
 		 370 aa  750    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.203138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11571  hypothetical protein  80.28 
 
 		 361 aa  610  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0991489 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0719  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  75.36 
 
 		 349 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.17492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15561  hypothetical protein  75.36 
 
 		 349 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.95378 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15611  hypothetical protein  68.61 
 
 		 354 aa  524  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.732375  normal  0.917864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0723  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  68.61 
 
 		 354 aa  524  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.543048  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11601  hypothetical protein  71.71 
 
 		 349 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0985613 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0717  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbH  67.33 
 
 		 351 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15541  hypothetical protein  67.33 
 
 		 351 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15601  hypothetical protein  64.77 
 
 		 362 aa  494  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.963648 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14531  hypothetical protein  66.96 
 
 		 355 aa  494  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358475 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0722  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbE  64.77 
 
 		 362 aa  494  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.683508  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0066  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbA  64.82 
 
 		 349 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06881  light-harvesting complex protein  65.1 
 
 		 349 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14281  hypothetical protein  63.24 
 
 		 365 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517015 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0627  light-harvesting complex protein  64.36 
 
 		 352 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11631  hypothetical protein  62.75 
 
 		 352 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0312993 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07351  light-harvesting complex protein  64.27 
 
 		 351 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.112937 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06541  light-harvesting complex protein  62.71 
 
 		 352 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06831  light-harvesting complex protein  62.71 
 
 		 352 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06931  light-harvesting complex protein  61.6 
 
 		 352 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1271  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  55.56 
 
 		 352 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0702178  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13721  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  55 
 
 		 352 aa  398  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09521  hypothetical protein  55.15 
 
 		 352 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722234 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13631  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  55.43 
 
 		 352 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08471  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  54.04 
 
 		 352 aa  391  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.679252  hitchhiker  0.00174435 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13421  hypothetical protein  54.87 
 
 		 352 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.233914  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0215  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  54.32 
 
 		 352 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10131  light-harvesting complex protein  54.85 
 
 		 350 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17721  light-harvesting complex protein  53.31 
 
 		 368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1005  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  49.16 
 
 		 359 aa  334  2e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1590  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  47.49 
 
 		 345 aa  324  2e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10047  hitchhiker  0.00277314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1795  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  40.68 
 
 		 359 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2434  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  40.45 
 
 		 342 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000346716  hitchhiker  0.0000000117955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1667  photosystem antenna protein-like  39.77 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00889751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1542  iron-stress chlorophyll-binding protein  40.45 
 
 		 342 aa  241  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398653  normal  0.0103257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2484  photosystem antenna protein-like  31.68 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.965644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2485  photosystem antenna protein-like  31.77 
 
 		 522 aa  156  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.90279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2483  photosystem antenna protein-like  29.64 
 
 		 368 aa  136  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13351  photosystem II PsbC protein (CP43)  30.66 
 
 		 460 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13251  photosystem II PsbC protein (CP43)  30.66 
 
 		 460 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  unclonable  0.000121028  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13501  photosystem II PsbC protein (CP43)  30.66 
 
 		 460 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.151398  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12341  photosystem II PsbC protein (CP43)  32.65 
 
 		 460 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.606702  normal  0.098859 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1257  photosystem II PsbC protein (CP43)  30.31 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0172037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0513  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  29.72 
 
 		 459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0656  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  30.88 
 
 		 461 aa  126  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08421  photosystem II PsbC protein (CP43)  30.07 
 
 		 464 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1060  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  31.23 
 
 		 461 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000366993  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16081  photosystem II PsbC protein (CP43)  30.31 
 
 		 460 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.548682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0768  photosystem II PsbC protein (CP43)  30.31 
 
 		 460 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0578  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  30.07 
 
 		 459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0217  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  31.58 
 
 		 473 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0294116  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0053  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  29.82 
 
 		 460 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000498494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0055  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  29.82 
 
 		 460 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1243  photosynthetic II protein PsbC  30.53 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1993  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  30 
 
 		 462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.296438  normal  0.146878 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0667  photosynthetic II protein PsbC  30.18 
 
 		 462 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.329399  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0697  photosystem II core light harvesting protein  30.81 
 
 		 508 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000016119  normal  0.0946335 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0861  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  28.57 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000036456  decreased coverage  0.00000114007 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4113  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  29.65 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1507  photosystem antenna protein-like  30.23 
 
 		 509 aa  57  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000124352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03471  photosystem II PsbB protein (CP47)  27.42 
 
 		 507 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1572  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  30.43 
 
 		 508 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04051  photosystem II PsbB protein (CP47)  27.52 
 
 		 507 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.644071 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1692  photosystem II PsbB protein (CP47)  27.52 
 
 		 507 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0321  photosystem II PsbB protein (CP47)  27.7 
 
 		 507 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03401  photosystem II PsbB protein (CP47)  27.36 
 
 		 507 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03391  photosystem II PsbB protein (CP47)  27.7 
 
 		 507 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0452672  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4666  photosystem antenna protein-like  28.32 
 
 		 508 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0622483  normal  0.0120025 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0470  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  28.57 
 
 		 519 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3069  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  29.81 
 
 		 508 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1864  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  28 
 
 		 519 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3051  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  29.81 
 
 		 508 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000997071  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03501  photosystem II PsbB protein (CP47)  24.84 
 
 		 518 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22121  photosystem II PsbB protein (CP47)  28.57 
 
 		 510 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>