More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0637 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0637  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14691  two-component response regulator  98.43 
 
 		 254 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.132919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10741  two-component response regulator  87.55 
 
 		 253 aa  430  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.6748  normal  0.476157 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12041  two-component response regulator  85.19 
 
 		 245 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1124  two component transcriptional regulator  86.01 
 
 		 245 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.747385  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12191  two-component response regulator  84.77 
 
 		 245 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12201  two-component response regulator  84.36 
 
 		 245 aa  394  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1420  two component transcriptional regulator  85.78 
 
 		 234 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09491  two-component response regulator  84.78 
 
 		 234 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.228862 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1663  two component transcriptional regulator  81.42 
 
 		 255 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2466  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 235 aa  132  6.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.28267  hitchhiker  0.0000000000126243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4398  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.184239 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0851  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.5 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.0165752 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2736  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00867541  hitchhiker  0.0000000494299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3375  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.22 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1263  two component transcriptional regulator  34.07 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2789  winged helix family two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 256 aa  113  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 222 aa  112  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  34.65 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.48 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02200  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.35 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  31.05 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2243  response regulator receiver protein  37.22 
 
 		 226 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0170584  normal  0.321433 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.29 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  35.19 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  34.5 
 
 		 240 aa  105  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1133  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.8 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1659  two component transcriptional regulator  37.23 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.8 
 
 		 227 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.8 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0675  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512652  normal  0.0931169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  31.7 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.84 
 
 		 226 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  31.51 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  31.51 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.9 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0905  two component transcriptional regulator  37.12 
 
 		 238 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.47 
 
 		 233 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.53 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1866  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  29.91 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0109  response regulator receiver  34.38 
 
 		 225 aa  102  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000662688  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.51 
 
 		 232 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.07 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 229 aa  101  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.16 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  34.06 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.46 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  31.05 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2151  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  30.36 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1600  two component transcriptional regulator  31.39 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000237714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  31.05 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0824  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.17 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2563  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  32.3 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  30.59 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.08 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.4 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.48 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2348  two component transcriptional regulator  31.53 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000162881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0753  putative response regulator  34.48 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  30.59 
 
 		 224 aa  99.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  35.14 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3534  response regulator receiver protein  32.88 
 
 		 225 aa  99.4  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.868885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  34.22 
 
 		 652 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.4 
 
 		 239 aa  98.6  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 226 aa  98.6  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2356  DNA-binding response regulator  29.13 
 
 		 232 aa  98.6  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.020915  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 		 224 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1752  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.84 
 
 		 228 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  31.54 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.89 
 
 		 244 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.64 
 
 		 219 aa  98.2  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000555295  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0257  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02492  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  33.04 
 
 		 229 aa  97.8  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.506678  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 230 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.48 
 
 		 231 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2892  two component transcriptional regulator  34.07 
 
 		 233 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  35.1 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0195  two component transcriptional regulator  33.79 
 
 		 222 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3452  two component transcriptional regulator  32.3 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00686704  hitchhiker  0.000158375 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.49 
 
 		 236 aa  97.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  29.68 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1397  two component transcriptional regulator  34.2 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0231814  hitchhiker  0.000111966 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 237 aa  97.1  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  36.24 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  34.19 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  33.83 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  32.9 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  32.77 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0286  response regulator receiver protein  32.88 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0097  two component transcriptional regulator  32.43 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.56 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>