More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0489 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  1035    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  96.66 
 
 		 509 aa  977    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  56.78 
 
 		 509 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  56.39 
 
 		 509 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  57.37 
 
 		 509 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  56.58 
 
 		 509 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  56.24 
 
 		 511 aa  590  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  55.45 
 
 		 510 aa  580  1e-164  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  52.27 
 
 		 516 aa  526  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  45.49 
 
 		 515 aa  489  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  46.28 
 
 		 512 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  45.64 
 
 		 512 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  45.44 
 
 		 512 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  40.37 
 
 		 554 aa  411  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  39.47 
 
 		 595 aa  378  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  37.55 
 
 		 598 aa  365  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  39.38 
 
 		 497 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  38.15 
 
 		 502 aa  346  5e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  38.76 
 
 		 506 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  36.82 
 
 		 513 aa  345  8e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  39.18 
 
 		 497 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  37.57 
 
 		 645 aa  342  7e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  35.76 
 
 		 530 aa  303  5.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  36.25 
 
 		 633 aa  301  2e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  33.46 
 
 		 512 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  33.27 
 
 		 512 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  33.27 
 
 		 504 aa  262  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  33.27 
 
 		 506 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  34.11 
 
 		 635 aa  256  6e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  33.46 
 
 		 516 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  32.34 
 
 		 508 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 		 506 aa  239  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  32.14 
 
 		 504 aa  237  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  31.76 
 
 		 520 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  31.99 
 
 		 514 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  30.37 
 
 		 520 aa  230  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 532 aa  229  9e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  31.43 
 
 		 520 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  30.66 
 
 		 518 aa  227  4e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  31.94 
 
 		 514 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  31.73 
 
 		 514 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  29.65 
 
 		 507 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  29.87 
 
 		 508 aa  220  6e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  31.74 
 
 		 514 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  30.41 
 
 		 518 aa  218  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 503 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  29.8 
 
 		 503 aa  212  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  28.15 
 
 		 522 aa  208  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  28.43 
 
 		 503 aa  204  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  28.44 
 
 		 505 aa  194  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  28.35 
 
 		 938 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  27.58 
 
 		 493 aa  154  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  25.84 
 
 		 498 aa  137  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25.94 
 
 		 511 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  24.8 
 
 		 511 aa  133  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  25.05 
 
 		 511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 		 554 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 717 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 559 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  25.34 
 
 		 507 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  26.69 
 
 		 544 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  24.61 
 
 		 511 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  23.63 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  27.92 
 
 		 535 aa  121  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  24.66 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 		 554 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  23.7 
 
 		 512 aa  116  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  26 
 
 		 711 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  25.57 
 
 		 507 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  23.05 
 
 		 508 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  25.76 
 
 		 499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  22.31 
 
 		 504 aa  111  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.57 
 
 		 740 aa  111  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 722 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  22.52 
 
 		 489 aa  110  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  25.89 
 
 		 708 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  23.93 
 
 		 508 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  24.7 
 
 		 501 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  23.64 
 
 		 531 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  23.83 
 
 		 555 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 547 aa  107  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  23.15 
 
 		 520 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  25.53 
 
 		 501 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  24.56 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  22.95 
 
 		 520 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  22.95 
 
 		 520 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  22.01 
 
 		 509 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 496 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  23.78 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 		 547 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  24.68 
 
 		 546 aa  99.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54800  carotenoid isomerase-like protein  23.85 
 
 		 923 aa  99.8  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0759229  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  24.72 
 
 		 499 aa  99.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  23.68 
 
 		 537 aa  99  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  22.65 
 
 		 504 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  23.91 
 
 		 510 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  24.17 
 
 		 492 aa  97.8  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  23.94 
 
 		 494 aa  97.4  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  25.82 
 
 		 523 aa  97.1  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>