259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0462 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  100 
 
 
282 aa  584  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  97.16 
 
 
282 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  74.16 
 
 
288 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  66.07 
 
 
294 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  68.12 
 
 
291 aa  397  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  57.93 
 
 
304 aa  339  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  48.09 
 
 
288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  50.19 
 
 
299 aa  263  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  46.42 
 
 
288 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  46.12 
 
 
270 aa  258  9e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  50.19 
 
 
301 aa  257  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  48.03 
 
 
297 aa  256  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  45.56 
 
 
279 aa  251  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  45.95 
 
 
279 aa  251  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  45.95 
 
 
276 aa  250  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  45.77 
 
 
274 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  43.27 
 
 
342 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  50.2 
 
 
303 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  43.28 
 
 
318 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  45.77 
 
 
268 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  45.59 
 
 
272 aa  246  3e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  45.38 
 
 
268 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  46.9 
 
 
284 aa  245  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  46.54 
 
 
299 aa  244  9e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  42.91 
 
 
315 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  42.91 
 
 
292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  42.91 
 
 
292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  45.38 
 
 
292 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  43.93 
 
 
288 aa  241  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  42.54 
 
 
319 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  42.54 
 
 
319 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  42.54 
 
 
319 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  46.95 
 
 
287 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  46.95 
 
 
287 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  43.21 
 
 
288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  41.97 
 
 
342 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  46.77 
 
 
287 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  48.09 
 
 
285 aa  236  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  48.05 
 
 
287 aa  235  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  43.89 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  45.21 
 
 
275 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  48.45 
 
 
283 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  43.43 
 
 
273 aa  229  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  46.09 
 
 
292 aa  228  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  44.15 
 
 
289 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  45.77 
 
 
305 aa  227  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  46.3 
 
 
301 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  44.53 
 
 
297 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  42.48 
 
 
261 aa  225  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  46.3 
 
 
291 aa  225  7e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  46.48 
 
 
287 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  45.14 
 
 
284 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  46.33 
 
 
299 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  47.2 
 
 
282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  46.51 
 
 
302 aa  219  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  43.91 
 
 
276 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  41.99 
 
 
296 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  46.9 
 
 
279 aa  215  8e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  39.69 
 
 
318 aa  199  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  56.63 
 
 
175 aa  198  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  39.92 
 
 
251 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  38.43 
 
 
271 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  48.55 
 
 
225 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  52.8 
 
 
147 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  45.24 
 
 
229 aa  142  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  43.27 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  43.6 
 
 
266 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  49.31 
 
 
247 aa  139  7e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  42.11 
 
 
313 aa  139  7e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  43.98 
 
 
267 aa  137  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  42.6 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  46.11 
 
 
278 aa  135  8e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  46.11 
 
 
273 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  41.57 
 
 
261 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  44.38 
 
 
264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  41.08 
 
 
229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  42.86 
 
 
244 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  44.58 
 
 
263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0299  hypothetical protein  46.63 
 
 
244 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000150026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  39.57 
 
 
220 aa  132  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  50 
 
 
263 aa  132  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  48.59 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  46.21 
 
 
280 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  46.9 
 
 
248 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0567  hypothetical protein  47.18 
 
 
242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.892575  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  47.3 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  36.15 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  44.22 
 
 
279 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  39.88 
 
 
317 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  46.48 
 
 
241 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  39.31 
 
 
317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  40.85 
 
 
235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  45.52 
 
 
266 aa  125  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  46.31 
 
 
216 aa  125  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  48.51 
 
 
247 aa  125  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  48.59 
 
 
241 aa  125  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  43.54 
 
 
245 aa  125  9e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  40 
 
 
263 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  48.87 
 
 
239 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  40.59 
 
 
242 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>