47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0394 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0394  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10841  hypothetical protein  98.7 
 
 
230 aa  470  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103566  hitchhiker  0.00469942 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10721  peptidase E  51.35 
 
 
226 aa  238  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10751  peptidase E  51.63 
 
 
226 aa  228  5e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.293161  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1000  hypothetical protein  50.92 
 
 
226 aa  228  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0358258  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10751  peptidase E  51.16 
 
 
226 aa  224  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.439295  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1676  peptidase S51 dipeptidase E  43.01 
 
 
194 aa  185  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0201  peptidase S51 dipeptidase E  35.09 
 
 
249 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3095  peptidase S51 dipeptidase E  33.77 
 
 
245 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277898  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02569  peptidase E  40.64 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2070  peptidase S51, dipeptidase E  33.33 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1268  peptidase S51 dipeptidase E  30.47 
 
 
248 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal  0.51146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1776  peptidase S51 dipeptidase E  31.09 
 
 
280 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125751  normal  0.183168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0200  peptidase S51 dipeptidase E  31.39 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2642  hypothetical protein  30.57 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100609  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3137  peptidase S51, dipeptidase E  31.25 
 
 
254 aa  125  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.638284  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2319  peptidase S51, dipeptidase E  33.33 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3365  peptidase S51 dipeptidase E  29.89 
 
 
244 aa  115  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225018  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00740  peptidase E  27.65 
 
 
240 aa  111  9e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3782  peptidase S51, dipeptidase E  30.32 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0136  peptidase S51, dipeptidase E  29.32 
 
 
247 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18450  peptidase E  29.63 
 
 
250 aa  102  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17206  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1620  peptidase S51 dipeptidase E  28.79 
 
 
243 aa  101  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.511149  normal  0.556978 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1748  peptidase S51 dipeptidase E  28.3 
 
 
201 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1273  peptidase S51 dipeptidase E  31.32 
 
 
241 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3283  peptidase S51 dipeptidase E  28.76 
 
 
243 aa  99  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.413219  normal  0.0948111 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1788  hypothetical protein  33.94 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1900  hypothetical protein  33.74 
 
 
232 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000489032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1622  peptidase E  33.74 
 
 
232 aa  95.5  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1643  hypothetical protein  33.74 
 
 
232 aa  95.5  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1824  hypothetical protein  33.74 
 
 
232 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1847  hypothetical protein  33.74 
 
 
232 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174476  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1774  hypothetical protein  33.74 
 
 
232 aa  95.5  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02370  peptidase E  25.97 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.946739  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1642  peptidase S51 dipeptidase E  29.08 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3556  hypothetical protein  32.73 
 
 
232 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.230544  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1592  peptidase E  33.74 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132542  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1420  peptidase S51 dipeptidase E  29.72 
 
 
232 aa  92  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4161  peptidase S51 dipeptidase E  30.22 
 
 
243 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000119415 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  23.08 
 
 
269 aa  52.8  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1683  Dipeptidase E  28.48 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140713  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37460  predicted protein  30.43 
 
 
211 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  21.97 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1567  peptidase E  27.22 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1095  cyanophycinase-like protein  27.94 
 
 
587 aa  42.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.092083  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1113  cyanophycinase  22.96 
 
 
284 aa  43.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0978  peptidase E  24.34 
 
 
245 aa  42.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>