23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0387 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0387  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.284943  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10691  hypothetical protein  98.67 
 
 
75 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0520111 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06491  hypothetical protein  59.46 
 
 
74 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04911  hypothetical protein  47.54 
 
 
74 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04841  hypothetical protein  44.26 
 
 
74 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0484083  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0428  hypothetical protein  44.26 
 
 
74 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04531  hypothetical protein  44.26 
 
 
74 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20651  hypothetical protein  38.98 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.193558 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04251  hypothetical protein  39.34 
 
 
85 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1572  hypothetical protein  37.93 
 
 
71 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.242669  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1760  hypothetical protein  35.62 
 
 
73 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04821  hypothetical protein  34.25 
 
 
73 aa  57.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0807  hypothetical protein  34.48 
 
 
71 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0825595  hitchhiker  0.00735224 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12711  hypothetical protein  32.79 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0340173  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0980  hypothetical protein  34.43 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0476003  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0018  hypothetical protein  35 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2782  hypothetical protein  36.84 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303018 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10501  hypothetical protein  29.51 
 
 
129 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3343  hypothetical protein  35 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06661  hypothetical protein  24.14 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.224874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1765  hypothetical protein  31.58 
 
 
66 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10511  hypothetical protein  29.51 
 
 
129 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1238  cytochrome b6-f complex subunit PetP  31.67 
 
 
64 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>