231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0305 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0305  50S ribosomal protein L28  100 
 
 		 78 aa  158  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.286615  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09781  50S ribosomal protein L28  100 
 
 		 78 aa  158  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.299661 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15261  50S ribosomal protein L28  85.9 
 
 		 78 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.412029 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1081  50S ribosomal protein L28  87.18 
 
 		 78 aa  141  4e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.933186  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1405  50S ribosomal protein L28  84.62 
 
 		 78 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08581  50S ribosomal protein L28  79.49 
 
 		 78 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122267 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09571  50S ribosomal protein L28  75.64 
 
 		 78 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.759768  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0898  50S ribosomal protein L28  73.08 
 
 		 78 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.512107  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09841  50S ribosomal protein L28  75.64 
 
 		 78 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.275607  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09591  50S ribosomal protein L28  73.08 
 
 		 78 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0503954  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0042  50S ribosomal protein L28  58.97 
 
 		 78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0615  50S ribosomal protein L28  58.97 
 
 		 78 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.149975  normal  0.298778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4126  50S ribosomal protein L28  58.97 
 
 		 78 aa  103  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2765  50S ribosomal protein L28  58.97 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3337  50S ribosomal protein L28  58.97 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.189365  normal  0.694787 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2853  ribosomal protein L28  55.84 
 
 		 78 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0142  50S ribosomal protein L28  55.26 
 
 		 78 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0995678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1605  50S ribosomal protein L28  53.95 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9941  predicted protein  53.42 
 
 		 73 aa  85.5  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4559  ribosomal protein L28  47.89 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.382747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2295  50S ribosomal protein L28  46.88 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0544676 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3521  ribosomal protein L28  48.44 
 
 		 77 aa  70.5  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2670  50S ribosomal protein L28  46.88 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0648  50S ribosomal protein L28P  43.75 
 
 		 80 aa  70.1  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13563  ribosomal protein L28  47.83 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0312  50S ribosomal protein L28  43.66 
 
 		 78 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000118312  normal  0.224841 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0325  ribosomal protein L28  40.85 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0601  50S ribosomal protein L28  44.93 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.201453  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0589  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.74438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0481  50S ribosomal protein L28  46.88 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0546  50S ribosomal protein L28  46.88 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1253  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3951  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 78 aa  67  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3087  ribosomal protein L28  43.66 
 
 		 78 aa  67  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.280967  normal  0.0287054 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0055  ribosomal protein L28  46.88 
 
 		 78 aa  67  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378886  normal  0.0544728 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2445  50S ribosomal protein L28  43.66 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2713  50S ribosomal protein L28  43.66 
 
 		 77 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3802  50S ribosomal protein L28  46.88 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2323  50S ribosomal protein L28  43.66 
 
 		 77 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837544 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2139  50S ribosomal protein L28  46.88 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0181781  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2339  ribosomal protein L28  45.31 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2139  ribosomal protein L28  45.31 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.476497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6556  ribosomal protein L28  46.88 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5365  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421212 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2722  50S ribosomal protein L28  45.31 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.238973  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36500  LSU ribosomal protein L28P  42.65 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.608 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3384  50S ribosomal protein L28  45.31 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.237994 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2314  ribosomal protein L28  42.19 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.959649  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1117  50S ribosomal protein L28  45.07 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0793  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2231  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1137  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5834  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.685508 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0780  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0817  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2527  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0584  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1891  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1734  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.111139  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2420  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.127484  hitchhiker  0.000900978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2549  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2502  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.553249  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3428  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0550772  normal  0.711167 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2647  50S ribosomal protein L28  45.31 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753369  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1021  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0978  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0983  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149835  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2100  50S ribosomal protein L28  45.31 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.295795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2733  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1452  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.843962 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4983  50S ribosomal protein L28  46.88 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0629  50S ribosomal protein L28  48.44 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000303775 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2870  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0696096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3214  50S ribosomal protein L28  45.31 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2589  50S ribosomal protein L28  45.31 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.155889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1757  50S ribosomal protein L28  40.85 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.991694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1995  ribosomal protein L28  40.62 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0544  50S ribosomal protein L28  42.19 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0520  50S ribosomal protein L28  42.19 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1710  50S ribosomal protein L28  40.85 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2640  ribosomal protein L28  42.19 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1989  50S ribosomal protein L28  40.85 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1282  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0544  50S ribosomal protein L28  40.58 
 
 		 72 aa  63.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.708685  normal  0.742505 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3565  50S ribosomal protein L28  40.85 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0150151  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3149  50S ribosomal protein L28  39.44 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.65679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2855  ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 78 aa  62  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.621933  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3180  50S ribosomal protein L28  45.31 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2021  ribosomal protein L28  42.19 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3143  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00769008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0570  hypothetical protein  43.75 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0629  50S ribosomal protein L28  40.85 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.865933  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2641  50S ribosomal protein L28P  36.62 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0753  50S ribosomal protein L28  40.85 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.542713 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1918  ribosomal protein L28  40.62 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6092  50S ribosomal protein L28  39.06 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70190  50S ribosomal protein L28  39.06 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0188  50S ribosomal protein L28  39.06 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3827  50S ribosomal protein L28  40.85 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.199336  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1960  50S ribosomal protein L28  40.62 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>