133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0297 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  194  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  194  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  67.82 
 
 
102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  55.1 
 
 
99 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  58.51 
 
 
98 aa  107  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  53.33 
 
 
92 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  54.44 
 
 
92 aa  98.2  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  53.33 
 
 
92 aa  97.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  53.33 
 
 
92 aa  97.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1066  hypothetical protein  55.32 
 
 
98 aa  92  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  53.75 
 
 
92 aa  82.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  50 
 
 
99 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  52.63 
 
 
92 aa  81.6  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  47.78 
 
 
98 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  50 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10630  predicted protein  58.82 
 
 
76 aa  76.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  48.61 
 
 
84 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36034  predicted protein  53.62 
 
 
237 aa  70.5  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119025  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  47.62 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2521  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3585  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  42.31 
 
 
87 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  41.54 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  43.66 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  40.85 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  39.74 
 
 
87 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  40.26 
 
 
87 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  49.3 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41246  predicted protein  43.28 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0509332  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  44.93 
 
 
199 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  41.33 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  39.74 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  41.56 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  38.46 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  38.46 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  38.46 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  38.46 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  38.46 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  43.24 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2082  protein of unknown function YGGT  44.62 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  hitchhiker  0.000000000000996106 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  40.86 
 
 
187 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  38.55 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  31.43 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3665  YGGT family protein  41.25 
 
 
181 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  40.86 
 
 
187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0517  hypothetical protein  39.51 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0567252  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  41.76 
 
 
213 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2017  hypothetical protein  35.14 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.314161 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  35.8 
 
 
192 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  40.86 
 
 
187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  41.76 
 
 
213 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  41.76 
 
 
213 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  41.76 
 
 
213 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  40.86 
 
 
187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  41.56 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  37.8 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  46.27 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  41 
 
 
187 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  41 
 
 
187 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 
187 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3708  protein of unknown function YGGT  36.62 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3030  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  37.8 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  40.28 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  40.28 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  45 
 
 
187 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4049  protein of unknown function YGGT  46.25 
 
 
187 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  39.53 
 
 
105 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08930  YGGT family protein  42.42 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.384516  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0063  hypothetical protein  30.26 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0469  protein of unknown function YGGT  45 
 
 
187 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0948  protein of unknown function YGGT  45 
 
 
187 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.199708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0910  protein of unknown function YGGT  45 
 
 
187 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00691  hypothetical protein  28.05 
 
 
102 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.82447 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  36.62 
 
 
88 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  39.73 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  42.25 
 
 
187 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0052  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03211  hypothetical protein  28.57 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  39.71 
 
 
196 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  39.73 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  39.71 
 
 
196 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  42.31 
 
 
196 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  42.31 
 
 
196 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1481  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
94 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  40.51 
 
 
196 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00731  hypothetical protein  26.19 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  38.24 
 
 
196 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1412  protein of unknown function YGGT  35.62 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  38.24 
 
 
196 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0607  protein of unknown function YGGT  39.13 
 
 
187 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0420  hypothetical protein  27.14 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00721  hypothetical protein  27.63 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  32.65 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  35.21 
 
 
178 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  32.97 
 
 
189 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  36.9 
 
 
196 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10668  predicted protein  37.88 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.605369 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2059  hypothetical protein  37.18 
 
 
91 aa  42.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1141  cell division membrane protein  40 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>