127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0260 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0260  anti-anti-sigma regulatory factor  100 
 
 		 99 aa  205  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09291  STAS domain-containing protein  96.97 
 
 		 99 aa  199  9e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0243906 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06941  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  69.79 
 
 		 115 aa  144  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00555121  normal  0.159245 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1153  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  66.67 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15781  STAS domain-containing protein  65.66 
 
 		 118 aa  141  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1306  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  63.64 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  51.06 
 
 		 114 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  50 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  46.39 
 
 		 132 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2424  anti-sigma-factor antagonist  48.39 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  48.39 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  42.55 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2283  anti-sigma-factor antagonist  44.83 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2311  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  51.61 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0655484 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003528  anti-anti-sigma regulatory factor  37.35 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3879  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  26.97 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  26.6 
 
 		 130 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  31.58 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  28.89 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  35 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02233  hypothetical protein  40.28 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0208  anti-sigma-factor antagonist  30.23 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0312  hypothetical protein, putative anti-sigma factor antagonist  32.14 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  30.38 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  25.29 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  28.09 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  25.76 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  30.38 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  24.51 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  23.53 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  27.66 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  27.59 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  24 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.96 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.08 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  26 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  28.79 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  24.21 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  26.74 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  32.47 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3448  anti-sigma-factor antagonist  29.07 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0429116  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  25.81 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.08 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  23.08 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  29.76 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.08 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4150  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  24.18 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  26.97 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  24.24 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  26.97 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  30.67 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  30.53 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.6 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  25.49 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  24.72 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  39.66 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  23 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4774  anti-sigma-factor antagonist  29.49 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558891  hitchhiker  0.00959736 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  29.07 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  21.98 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  21.98 
 
 		 112 aa  43.5  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  21.98 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  21.98 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  23.16 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  22.73 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3284  anti-sigma-factor antagonist  27.59 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.156911  normal  0.806624 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  27 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1681  anti-anti-sigma factor family protein  23.53 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0820  anti-sigma-factor antagonist  30.38 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  29.27 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2530  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12656  hypothetical protein  23.53 
 
 		 148 aa  42  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000514041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  28.24 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  25.84 
 
 		 113 aa  42  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  24.27 
 
 		 112 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.27 
 
 		 115 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  25.51 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2021  anti-sigma-factor antagonist  21.21 
 
 		 112 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  0.594301 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>