62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0245 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_09131  hypothetical protein  99.49 
 
 
395 aa  806    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.554848  hitchhiker  0.00082103 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0245  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  811    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06741  hypothetical protein  77.66 
 
 
402 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0870482  normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08941  hypothetical protein  76.14 
 
 
408 aa  631  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0837  hypothetical protein  76.65 
 
 
408 aa  631  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08961  hypothetical protein  75.89 
 
 
408 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.359171  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10451  hypothetical protein  74.87 
 
 
408 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2607  hypothetical protein  65.82 
 
 
430 aa  556  1e-157  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166847  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2244  hypothetical protein  65.82 
 
 
425 aa  553  1e-156  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0737  hypothetical protein  40.2 
 
 
404 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1772  cell wall biogenesis glycosyltransferase  35.55 
 
 
409 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2340  hypothetical protein  36.88 
 
 
404 aa  242  7.999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122149  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2567  cell wall biogenesis glycosyltransferase  35.32 
 
 
407 aa  239  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0206766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2574  cell wall biogenesis glycosyltransferase  35.32 
 
 
407 aa  239  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00191842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2581  cell wall biogenesis glycosyltransferase  35.32 
 
 
407 aa  239  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000562395  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2603  hypothetical protein  36.53 
 
 
406 aa  239  9e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02160  cell wall biogenesis glycosyltransferase  34.79 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2163  cell wall biogenesis glycosyltransferase  34.7 
 
 
409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.407321  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2052  hypothetical protein  35.84 
 
 
405 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2847  hypothetical protein  34.58 
 
 
406 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663115  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3209  hypothetical protein  34.58 
 
 
406 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1821  hypothetical protein  34.73 
 
 
416 aa  230  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117561  normal  0.653656 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2129  hypothetical protein  35.31 
 
 
408 aa  229  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1890  hypothetical protein  35.06 
 
 
409 aa  226  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116319  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0773  hypothetical protein  34.19 
 
 
403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2601  hypothetical protein  34.49 
 
 
408 aa  226  7e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.625325  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0507  hypothetical protein  34.7 
 
 
408 aa  222  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551714  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0420  cell wall biogenesis glycosyltransferase  34.58 
 
 
409 aa  220  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.414661  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2502  putative glycosyltransferase  31.55 
 
 
403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0127877  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1195  glycosyltransferase-like protein  32.01 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.809596  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2620  glycosyltransferase-like protein  30.28 
 
 
448 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3045  glycosyltransferase-like protein  30.24 
 
 
363 aa  159  6e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1287  cell wall biogenesis glycosyltransferase  33.43 
 
 
373 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1456  glycosyltransferase-like protein  31.23 
 
 
397 aa  150  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.443232  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.88 
 
 
334 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  32.61 
 
 
326 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  32.8 
 
 
299 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  34.25 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.44 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  31.32 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  25.79 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  30.94 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  32.61 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2488  glycosyl transferase family 2  31.38 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468454  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  31.46 
 
 
342 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0337  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 
320 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5332  glycosyl transferase family 2  34.16 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  31.52 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2312  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  30.81 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0167  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  33.52 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.33874  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0338  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3452  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  32.22 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.0411609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1165  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2860  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.31 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125006  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1142  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.01 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.67 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.67 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.67 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  34.27 
 
 
330 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  28.25 
 
 
510 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0071  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
393 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>