75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0237 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  100 
 
 
437 aa  865    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  99.77 
 
 
437 aa  862    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  72.77 
 
 
435 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  71.03 
 
 
436 aa  617  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  72.13 
 
 
434 aa  614  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  72.13 
 
 
434 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  71.9 
 
 
434 aa  594  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  68.16 
 
 
431 aa  568  1e-161  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  67.45 
 
 
460 aa  554  1e-156  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  39.19 
 
 
428 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  37.86 
 
 
428 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  38.9 
 
 
424 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  37.71 
 
 
425 aa  259  6e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  39.1 
 
 
424 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  38.97 
 
 
421 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  38.66 
 
 
424 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  38.66 
 
 
424 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  38.21 
 
 
428 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  37.47 
 
 
424 aa  255  9e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  37.95 
 
 
424 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  36.49 
 
 
422 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  35.51 
 
 
428 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  39.43 
 
 
452 aa  237  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  35.25 
 
 
428 aa  237  4e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  35.85 
 
 
421 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  37.33 
 
 
433 aa  229  6e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  36.67 
 
 
433 aa  225  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  33.33 
 
 
421 aa  225  1e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  35.05 
 
 
396 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  34.67 
 
 
382 aa  220  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  35.71 
 
 
419 aa  219  6e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  33.94 
 
 
421 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  33.81 
 
 
423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  35.51 
 
 
421 aa  213  5.999999999999999e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  36.38 
 
 
422 aa  213  5.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  34.03 
 
 
422 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  34.4 
 
 
420 aa  206  6e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  33.41 
 
 
427 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  33.25 
 
 
418 aa  195  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4143  Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family- like protein  25.81 
 
 
440 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  22.77 
 
 
427 aa  68.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  20.87 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  25.34 
 
 
416 aa  64.3  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  23.4 
 
 
468 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  22.82 
 
 
415 aa  61.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  23.68 
 
 
429 aa  59.7  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  24.28 
 
 
453 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  26.22 
 
 
406 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  20.57 
 
 
435 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  23.99 
 
 
429 aa  51.6  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  25.86 
 
 
433 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  20.8 
 
 
508 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  31.66 
 
 
397 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  29.76 
 
 
432 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  23.71 
 
 
450 aa  47  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  23.71 
 
 
450 aa  47  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  21.8 
 
 
432 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  28.22 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  28.22 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  28.22 
 
 
430 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3647  natural resistance-associated macrophage protein  34.52 
 
 
418 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.438351  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  24.06 
 
 
428 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  23.27 
 
 
438 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  23.95 
 
 
415 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  21.94 
 
 
433 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.446003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  21.9 
 
 
419 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  21.57 
 
 
434 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  23.34 
 
 
437 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  23.34 
 
 
437 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  23.34 
 
 
437 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  23.34 
 
 
437 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  23.34 
 
 
437 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  25.96 
 
 
453 aa  43.9  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  22.99 
 
 
418 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  23.61 
 
 
415 aa  43.1  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.612589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>