80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0236 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  100 
 
 
262 aa  507  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  100 
 
 
262 aa  507  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29101  membrane protein, multidrug efflux associated  62.21 
 
 
262 aa  342  5e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  61.07 
 
 
262 aa  295  4e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3771  protein of unknown function DUF990  52.29 
 
 
260 aa  262  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.616684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0859  hypothetical protein  51.91 
 
 
260 aa  259  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0060  protein of unknown function DUF990  49.81 
 
 
262 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0058  protein of unknown function DUF990  49.81 
 
 
262 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0285838  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1498  hypothetical protein  49.24 
 
 
260 aa  251  9.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2555  membrane protein, multidrug efflux associated  62.6 
 
 
262 aa  247  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10531  membrane protein, multidrug efflux associated  50 
 
 
277 aa  242  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0983  membrane protein, multidrug efflux associated  45.8 
 
 
264 aa  241  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.594121  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0886  hypothetical protein  49.62 
 
 
259 aa  241  6e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0866325  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  46.18 
 
 
264 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.826681  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4243  protein of unknown function DUF990  49.62 
 
 
260 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000148209  hitchhiker  0.000000472555 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0803  hypothetical protein  48.85 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.386631  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  45.8 
 
 
264 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2816  protein of unknown function DUF990  48.08 
 
 
259 aa  229  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0376428 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1946  hypothetical protein  48.47 
 
 
260 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1964  protein of unknown function DUF990  33.97 
 
 
262 aa  175  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000269589  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  35.19 
 
 
262 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  31.8 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  33.08 
 
 
261 aa  151  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2321  protein of unknown function DUF990  29.77 
 
 
262 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4171  hypothetical protein  34.85 
 
 
262 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.068951 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0429  protein of unknown function DUF990  33.33 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  32.95 
 
 
262 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0400  hypothetical protein  33.33 
 
 
262 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0739  protein of unknown function DUF990  28.09 
 
 
277 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3393  conserved membrane protein, putative multidrug efflux associated  25.67 
 
 
261 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120768  hitchhiker  0.0000000768591 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3864  hypothetical protein  27.38 
 
 
260 aa  95.9  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  26.2 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0545  protein of unknown function DUF990  25.84 
 
 
265 aa  92.4  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.931228  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  25.38 
 
 
261 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  25.57 
 
 
260 aa  85.1  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  24.9 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0892  ABC transporter, permease protein  22.52 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  25.4 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  24.14 
 
 
261 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  24.14 
 
 
261 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  24.14 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  24.14 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  25.86 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  24.14 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  24.14 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  24.14 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  26.98 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  24.14 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  25.38 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  25.86 
 
 
261 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  24.27 
 
 
263 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  23.85 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0913  protein of unknown function DUF990  25.7 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2653  hypothetical protein  26.34 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2521  protein of unknown function DUF990  22.06 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  normal  0.519052 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  25.4 
 
 
263 aa  63.9  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0552  hypothetical protein  23.68 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.268475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0538  protein of unknown function DUF990  23.68 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2222  protein of unknown function DUF990  22.1 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3778  hypothetical protein  23.31 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  27.72 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  23.72 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1505  protein of unknown function DUF990  22.39 
 
 
262 aa  60.5  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000124255  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0524  hypothetical protein  23.08 
 
 
267 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  24.34 
 
 
278 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3537  hypothetical protein  20.16 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12830  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  25.09 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.75127  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3152  protein of unknown function DUF990  25.38 
 
 
267 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129071  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  22.99 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2675  hypothetical protein  22.27 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.187559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4136  protein of unknown function DUF990  25.23 
 
 
272 aa  49.3  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0894  hypothetical protein  25 
 
 
263 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1067  hypothetical protein  24.83 
 
 
267 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  23.66 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1830  hypothetical protein  21.65 
 
 
265 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0177  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  27.81 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.390297  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1442  protein of unknown function DUF990  23.28 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2071  hypothetical protein  21.23 
 
 
267 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151381  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1283  protein of unknown function DUF990  28.02 
 
 
262 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  26.37 
 
 
262 aa  42.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>