190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0228 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0228  ferredoxin, PetF like protein  100 
 
 		 128 aa  266  7e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11908  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08951  ferredoxin, PetF like protein  100 
 
 		 128 aa  266  7e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104451  hitchhiker  0.000234569 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  66.41 
 
 		 121 aa  184  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09201  ferredoxin  61.72 
 
 		 121 aa  168  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.354651  hitchhiker  0.00000103216 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1400  ferredoxin  59.84 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.385733  normal  0.502771 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1087  ferredoxin  58.27 
 
 		 125 aa  156  7e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  53.91 
 
 		 122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  53.91 
 
 		 122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  49.61 
 
 		 122 aa  127  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09801  ferredoxin, petF-like protein  46.88 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  48.82 
 
 		 122 aa  122  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0902  ferredoxin, petF-like protein  49.22 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.180357  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  47.24 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09631  ferredoxin, petF-like protein  48.44 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09611  ferredoxin, petF-like protein  47.66 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.511459  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  48.82 
 
 		 122 aa  120  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  45.53 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  40.94 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9385  predicted protein  47.71 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  40.71 
 
 		 106 aa  87  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  38.32 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  42.48 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  41.44 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  41.44 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  40.91 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  34.86 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  36.52 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  33.62 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  35.4 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  37.25 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  33.63 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  35.34 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  35.34 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  36.89 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  36.89 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  33.98 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  33.98 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  33.98 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  33.98 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  33.98 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  33.98 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  35.92 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  33.98 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  33.98 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  35.92 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  34.29 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  33.98 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  39.53 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  33.01 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  41.54 
 
 		 373 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_8944  predicted protein  31.13 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0099  ferredoxin  36.36 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  35.96 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  35.96 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  31.91 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  36.27 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1737  ferredoxin  36 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  32.71 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0368  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  45.28 
 
 		 349 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000152179  unclonable  0.0000000536211 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  33.33 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  32.58 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  36.9 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1779  ferredoxin  38.38 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  40.28 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2408  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40 
 
 		 343 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5822  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40 
 
 		 343 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  0.0803192 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  36.36 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2515  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40 
 
 		 343 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1879  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40 
 
 		 343 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2537  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40 
 
 		 343 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2490  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40 
 
 		 343 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  32.35 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1377  ferredoxin  36.99 
 
 		 344 aa  50.4  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  43.06 
 
 		 104 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  29.25 
 
 		 102 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  36.78 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  34.31 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  40.28 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  38.89 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3091  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.97 
 
 		 357 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255521  hitchhiker  0.000372207 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0757  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.88 
 
 		 358 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123298  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.33 
 
 		 358 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367598 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3387  ferredoxin  32.67 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.864897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4980  ferredoxin  32.67 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5307  ferredoxin  32.67 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.786726  normal  0.0713222 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0805  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.14 
 
 		 343 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  27.78 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.59 
 
 		 385 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0452  heat shock protein DnaJ domain protein  35.14 
 
 		 209 aa  47.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0697  ferredoxin  35.29 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  32.56 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2176  ferredoxin  31.68 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.378228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3274  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32 
 
 		 358 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1903  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  27.37 
 
 		 368 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2485  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32 
 
 		 358 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.88 
 
 		 343 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.71 
 
 		 343 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1966  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.71 
 
 		 343 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0683406  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.74 
 
 		 386 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2635  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30.67 
 
 		 358 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.0570519 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>