More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0221 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0221  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 		 347 aa  709    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.000600389  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08531  UDP-glucose 4-epimerase  79.83 
 
 		 348 aa  597  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.264639  hitchhiker  0.00180619 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12831  UDP-glucose-4-epimerase  51.3 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.225757  normal  0.0431014 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25441  UDP-glucose-4-epimerase  50.14 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0215  UDP-glucose 4-epimerase  48.41 
 
 		 344 aa  362  5.0000000000000005e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  48.27 
 
 		 338 aa  354  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  48.55 
 
 		 339 aa  351  8e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  49.13 
 
 		 338 aa  350  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0187  UDP-galactose 4-epimerase  47.56 
 
 		 344 aa  350  3e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.611091  decreased coverage  0.00729822 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  48.84 
 
 		 338 aa  348  6e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  47.4 
 
 		 339 aa  347  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  50.29 
 
 		 335 aa  346  3e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2911  UDP-glucose 4-epimerase  49.57 
 
 		 342 aa  346  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  46.48 
 
 		 353 aa  346  4e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 		 337 aa  345  5e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  48.7 
 
 		 335 aa  345  7e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  49.28 
 
 		 340 aa  345  8e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  47.55 
 
 		 337 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  49.86 
 
 		 335 aa  345  8.999999999999999e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0107  UDP-galactose 4-epimerase  47.13 
 
 		 343 aa  344  1e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  48.41 
 
 		 339 aa  344  1e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  46.82 
 
 		 338 aa  343  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  49.86 
 
 		 338 aa  343  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14241  UDP-glucose 4-epimerase  48.56 
 
 		 352 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.353629  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1793  UDP-glucose 4-epimerase  46.7 
 
 		 341 aa  342  4e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  48.27 
 
 		 337 aa  342  5.999999999999999e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 		 337 aa  342  8e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  45.95 
 
 		 336 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  46.69 
 
 		 337 aa  338  7e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 		 337 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0116  UDP-glucose 4-epimerase  47.7 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  44.09 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 		 336 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.179551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  47.26 
 
 		 337 aa  336  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  47.97 
 
 		 334 aa  335  9e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  46.82 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  46.69 
 
 		 337 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  46.69 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  47.13 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  45.09 
 
 		 339 aa  335  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0346  UDP-glucose 4-epimerase  46.96 
 
 		 351 aa  333  2e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  45.24 
 
 		 339 aa  333  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  46.53 
 
 		 337 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0024  UDP-glucose 4-epimerase  45.16 
 
 		 332 aa  333  4e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  46.82 
 
 		 337 aa  332  5e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  47.77 
 
 		 335 aa  332  6e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  46.24 
 
 		 337 aa  332  6e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27450  UDP-galactose 4-epimerase  46.89 
 
 		 355 aa  332  6e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  45.09 
 
 		 338 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  45.66 
 
 		 341 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2339  UDP-galactose 4-epimerase  47.55 
 
 		 349 aa  332  8e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569597  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5166  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 		 336 aa  332  8e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  45.38 
 
 		 338 aa  331  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  46.09 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  44.8 
 
 		 338 aa  331  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  45.95 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  46.26 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  46.24 
 
 		 336 aa  330  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1317  UDP-galactose 4-epimerase  45.93 
 
 		 352 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.218499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  44.51 
 
 		 338 aa  329  3e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  45.4 
 
 		 342 aa  329  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  46.53 
 
 		 335 aa  329  4e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  45.79 
 
 		 351 aa  329  4e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  46.4 
 
 		 373 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46785  UDP-glucose 4-epimerase  46.26 
 
 		 358 aa  328  7e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  44.51 
 
 		 336 aa  328  8e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  44.51 
 
 		 338 aa  328  8e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  46.97 
 
 		 337 aa  328  9e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  45.95 
 
 		 337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  45.4 
 
 		 339 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1537  UDP-glucose 4-epimerase  47.06 
 
 		 339 aa  327  1.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1892  UDP-galactose 4-epimerase  45.51 
 
 		 377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  45.93 
 
 		 340 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  46.82 
 
 		 338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2824  UDP-galactose 4-epimerase  49.71 
 
 		 351 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  45.8 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  45.7 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1059  UDP-glucose 4-epimerase  46.69 
 
 		 336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0878912 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  45.8 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  45.38 
 
 		 337 aa  327  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  44.09 
 
 		 337 aa  326  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  46.55 
 
 		 338 aa  326  4.0000000000000003e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2943  UDP-galactose-4-epimerase  45.82 
 
 		 338 aa  325  5e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2855  UDP-galactose-4-epimerase  45.82 
 
 		 338 aa  325  5e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3395  UDP-glucose 4-epimerase  48.85 
 
 		 338 aa  325  6e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  46.4 
 
 		 341 aa  325  6e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  43.35 
 
 		 338 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  43.35 
 
 		 338 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2597  UDP-glucose 4-epimerase  45.95 
 
 		 338 aa  325  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.305151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  44.22 
 
 		 338 aa  324  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  43.35 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1413  UDP-galactose-4-epimerase  45.53 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3183  UDP-glucose 4-epimerase  47.55 
 
 		 339 aa  323  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.670308 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27190  predicted protein  44.35 
 
 		 365 aa  324  2e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  43.35 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2530  UDP-glucose 4-epimerase  47.4 
 
 		 337 aa  323  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000741336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  45.35 
 
 		 340 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  45.09 
 
 		 337 aa  322  4e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  44.48 
 
 		 340 aa  322  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2591  UDP-galactose 4-epimerase  45.38 
 
 		 337 aa  323  4e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>