222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0170 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  100 
 
 
395 aa  787    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  96.71 
 
 
395 aa  734    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  59.15 
 
 
401 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  54.4 
 
 
403 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  51.84 
 
 
384 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  52.34 
 
 
401 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  50.89 
 
 
401 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  49.87 
 
 
386 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  48.03 
 
 
400 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  45.93 
 
 
386 aa  318  9e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  39.19 
 
 
392 aa  286  5e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  36.94 
 
 
394 aa  280  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  38.68 
 
 
388 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  35.12 
 
 
391 aa  260  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  35.12 
 
 
391 aa  248  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  36.21 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  36.21 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  36.76 
 
 
395 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  36.76 
 
 
395 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  33.86 
 
 
374 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  32.88 
 
 
434 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  30.97 
 
 
365 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  31.32 
 
 
389 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  27.81 
 
 
356 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  27.82 
 
 
389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  24.33 
 
 
356 aa  119  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  29.79 
 
 
1040 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  28.02 
 
 
399 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  28.27 
 
 
391 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  24.22 
 
 
418 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  27.25 
 
 
391 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  25.39 
 
 
358 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  26.65 
 
 
364 aa  95.9  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  28.19 
 
 
391 aa  93.6  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  23.36 
 
 
403 aa  93.2  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  24.21 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  24.24 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  24.27 
 
 
360 aa  90.1  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  25.5 
 
 
387 aa  90.1  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  24 
 
 
360 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 
394 aa  89  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  23.53 
 
 
360 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  22.92 
 
 
792 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 
364 aa  86.7  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  24 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  22.48 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  22.96 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  23.4 
 
 
358 aa  82.8  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  23.15 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  22.83 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  23.18 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  35.04 
 
 
444 aa  79.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  23.83 
 
 
443 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  22.57 
 
 
356 aa  79  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  23.47 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  22.94 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  24.27 
 
 
418 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  21.5 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  23.58 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  21.58 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  24.18 
 
 
1153 aa  75.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  22.93 
 
 
1111 aa  75.5  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  29.41 
 
 
441 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  22.36 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0048  permease YjgP/YjgQ  22.62 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  22.01 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  23.38 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  22.91 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  21.68 
 
 
1061 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  22.68 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  21.68 
 
 
1061 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  23.01 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  22.67 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  25.2 
 
 
441 aa  66.6  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  22.4 
 
 
392 aa  66.2  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  29.1 
 
 
442 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  23.04 
 
 
442 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  28.4 
 
 
481 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  21.82 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  22.88 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  26.03 
 
 
495 aa  63.5  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0684  permease YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 
346 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000671821  normal  0.0817909 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  25.68 
 
 
379 aa  63.2  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  21.43 
 
 
371 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  21.43 
 
 
371 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  23.18 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  29.77 
 
 
478 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  24.61 
 
 
360 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 
359 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  19.34 
 
 
350 aa  61.6  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  22.29 
 
 
356 aa  60.8  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  21.16 
 
 
368 aa  60.8  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0837  hypothetical protein  21.8 
 
 
429 aa  60.8  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00840057  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2199  YjgP/YjgQ family protein  23.47 
 
 
357 aa  60.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1855  permease YjgP/YjgQ family protein  23.47 
 
 
357 aa  60.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  21.61 
 
 
362 aa  60.5  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  20.83 
 
 
371 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  20.57 
 
 
378 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  25.32 
 
 
360 aa  60.1  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  20.77 
 
 
1096 aa  59.3  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>