43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0151 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0151  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  100 
 
 
241 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07831  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  97.4 
 
 
231 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.299977  normal  0.406136 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10161  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  51.08 
 
 
276 aa  240  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0919672 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16581  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  46.09 
 
 
264 aa  222  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1253  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  45.02 
 
 
246 aa  199  3e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1216  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  43.91 
 
 
247 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.261632  normal  0.953756 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08081  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  41.48 
 
 
241 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0987518  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08071  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  41.92 
 
 
241 aa  181  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0755  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  41.92 
 
 
241 aa  181  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.574413  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1748  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  41.98 
 
 
245 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1724  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  41.98 
 
 
245 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08371  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  40.87 
 
 
241 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.336016  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0093  ferredoxin-dependent bilin reductase  38.93 
 
 
245 aa  173  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4156  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  38.96 
 
 
245 aa  172  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3585  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  38.02 
 
 
245 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.561892  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4845  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  41.04 
 
 
259 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1047  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  40.34 
 
 
245 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866548 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1225  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  39.08 
 
 
248 aa  157  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.441578 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31381  predicted protein  29.06 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5729  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  27.06 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0422  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  30.32 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.4392  normal  0.0295083 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4518  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  25.31 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5050  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  31.12 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22441  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  26.74 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1907  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  31.41 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5051  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  25.26 
 
 
244 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1167  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  29.27 
 
 
258 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20421  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  29.27 
 
 
258 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17131  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  27.95 
 
 
257 aa  62  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.93922 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5728  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  25.93 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10830  predicted protein  23.04 
 
 
183 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1906  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  22.22 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.176317  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20431  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  23.98 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1168  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  23.98 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.561084  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22431  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  24.38 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0423  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  22.33 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.544521  normal  0.0602885 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4517  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  23.4 
 
 
246 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.991072  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17141  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  22.91 
 
 
238 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.695365  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33770  predicted protein  22.45 
 
 
381 aa  46.2  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18021  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  24.78 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.242937  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1685  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  26.61 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.399665  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17851  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  26.27 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.399426  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15568  predicted protein  22.28 
 
 
322 aa  42  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>