More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0112 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  100 
 
 
328 aa  680    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  98.17 
 
 
328 aa  669    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  70.96 
 
 
310 aa  482  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  69.55 
 
 
310 aa  478  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  65.73 
 
 
333 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  66.45 
 
 
312 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  65.79 
 
 
304 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  65.13 
 
 
304 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  64.8 
 
 
304 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  64.47 
 
 
304 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  57.41 
 
 
324 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  59.21 
 
 
323 aa  402  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  59.87 
 
 
325 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  59.87 
 
 
325 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  58.03 
 
 
322 aa  394  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  57.84 
 
 
317 aa  391  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1448  quinolinate synthetase  56.92 
 
 
320 aa  389  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  58.22 
 
 
323 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  56.82 
 
 
322 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  58.22 
 
 
320 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  57.19 
 
 
329 aa  384  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  56.25 
 
 
334 aa  386  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  57.93 
 
 
330 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  56.58 
 
 
332 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4715  quinolinate synthetase  55.56 
 
 
348 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0705171  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0089  quinolinate synthetase  55.56 
 
 
332 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  53.27 
 
 
331 aa  353  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.12 
 
 
310 aa  350  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  54.36 
 
 
338 aa  347  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5129  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.94 
 
 
329 aa  347  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0015  quinolinate synthetase  54.43 
 
 
313 aa  342  4e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0036  quinolinate synthetase  54.4 
 
 
314 aa  342  7e-93  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.529941  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  50.16 
 
 
322 aa  331  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1168  quinolinate synthetase  48.84 
 
 
319 aa  325  6e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.975309  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  47.71 
 
 
321 aa  325  7e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0969  quinolinate synthetase  50 
 
 
315 aa  322  5e-87  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.814185  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2150  quinolinate synthetase complex, A subunit  50.49 
 
 
311 aa  317  2e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.484842  normal  0.0905755 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  48.84 
 
 
311 aa  317  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  49.5 
 
 
318 aa  317  3e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0821  quinolinate synthetase  47.06 
 
 
323 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0646463  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0868  quinolinate synthetase  47.54 
 
 
324 aa  311  1e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.56 
 
 
307 aa  294  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1159  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.67 
 
 
341 aa  291  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.39 
 
 
303 aa  289  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  44.87 
 
 
307 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.75 
 
 
301 aa  280  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.33 
 
 
298 aa  278  9e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.59 
 
 
324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  46.05 
 
 
308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  46.23 
 
 
304 aa  273  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1578  quinolinate synthetase  43.37 
 
 
308 aa  272  6e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  45.39 
 
 
304 aa  271  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  45.64 
 
 
301 aa  269  4e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  44.92 
 
 
304 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  45.3 
 
 
301 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  44.08 
 
 
331 aa  266  5e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2197  quinolinate synthetase  44.01 
 
 
348 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293101  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1740  quinolinate synthetase  41.35 
 
 
352 aa  263  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.92 
 
 
303 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  43.81 
 
 
326 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2449  quinolinate synthetase  41.46 
 
 
382 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  44.55 
 
 
304 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4393  quinolinate synthetase  43.42 
 
 
352 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1282  quinolinate synthetase  42.9 
 
 
352 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0632  quinolinate synthetase  42.58 
 
 
379 aa  260  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  44.55 
 
 
304 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51330  quinolinate synthetase  43.75 
 
 
352 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000717846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  44.08 
 
 
304 aa  259  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  43.95 
 
 
323 aa  257  2e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0600  quinolinate synthetase  41.29 
 
 
379 aa  257  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.287851  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  44.22 
 
 
304 aa  256  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2717  quinolinate synthetase  41.56 
 
 
382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4097  quinolinate synthetase  43.1 
 
 
374 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  44.3 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1964  quinolinate synthetase  40.58 
 
 
395 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2327  quinolinate synthetase  41.21 
 
 
382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0615138 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11610  quinolinate synthetase  44.41 
 
 
349 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.681965  normal  0.363525 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0580  quinolinate synthetase  41.03 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916208  normal  0.575901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  45.15 
 
 
305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0891  quinolinate synthetase  40.06 
 
 
358 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000130385  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1789  quinolinate synthetase  41.21 
 
 
355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2874  quinolinate synthetase  41.01 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0746  quinolinate synthetase  39.44 
 
 
356 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1938  quinolinate synthetase  42.11 
 
 
355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43657  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  44.55 
 
 
306 aa  253  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0903  quinolinate synthetase  42.07 
 
 
377 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  44.92 
 
 
306 aa  253  3e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0793  quinolinate synthetase  40.18 
 
 
352 aa  253  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0774972  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1696  quinolinate synthetase  41.43 
 
 
353 aa  253  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1554  quinolinate synthetase  42.57 
 
 
371 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02681  quinolinate synthetase  41.19 
 
 
345 aa  252  5.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000074326  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0476  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.19 
 
 
361 aa  252  6e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00468623  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3981  quinolinate synthetase  41.78 
 
 
352 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857271  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1254  quinolinate synthetase  40.97 
 
 
353 aa  252  8.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00563741  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  42 
 
 
303 aa  251  9.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  41.45 
 
 
334 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4187  quinolinate synthetase  41.45 
 
 
352 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152766  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1231  quinolinate synthetase  41.45 
 
 
352 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.687008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1542  quinolinate synthetase  41.12 
 
 
352 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.061023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1319  quinolinate synthetase  40.78 
 
 
378 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>