23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0085 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0085  FAD linked oxidase, N-terminal  100 
 
 		 336 aa  684    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.68983  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07091  FAD linked oxidase, N-terminal  96.13 
 
 		 336 aa  642    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.105041  normal  0.609294 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12191  FAD linked oxidase, N-terminal  50.44 
 
 		 394 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07561  FAD linked oxidase, N-terminal  50.29 
 
 		 428 aa  318  7e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.434173  hitchhiker  0.00617401 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0645  FAD linked oxidase, N-terminal  42.77 
 
 		 425 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07011  FAD linked oxidase, N-terminal  42.6 
 
 		 424 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.979719  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07111  FAD linked oxidase, N-terminal  42.53 
 
 		 426 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0844  hypothetical protein  41.37 
 
 		 403 aa  256  4e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06721  FAD linked oxidase, N-terminal  41.3 
 
 		 426 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1811  hypothetical protein  39.58 
 
 		 401 aa  241  9e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.244893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  21.71 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.22 
 
 		 466 aa  59.3  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.78 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  21.78 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  21.94 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0479  hypothetical protein  21.73 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  20.17 
 
 		 474 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.29 
 
 		 474 aa  52.8  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  21.2 
 
 		 461 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  21.88 
 
 		 473 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  22.43 
 
 		 758 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  20 
 
 		 479 aa  46.6  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.13 
 
 		 574 aa  42.7  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>