120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0078 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  642    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  97.77 
 
 		 314 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  57.84 
 
 		 332 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  58.63 
 
 		 311 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  56.23 
 
 		 314 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  59.16 
 
 		 310 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  56.15 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  58.84 
 
 		 310 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  53.82 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  57.98 
 
 		 317 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  59.49 
 
 		 310 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  54.98 
 
 		 320 aa  362  4e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  57.79 
 
 		 310 aa  362  6e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  53.23 
 
 		 321 aa  355  6.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  51.43 
 
 		 319 aa  338  7e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  54.6 
 
 		 320 aa  336  1.9999999999999998e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  54.07 
 
 		 322 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  49.84 
 
 		 319 aa  335  5.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  49.54 
 
 		 329 aa  329  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  53.49 
 
 		 358 aa  324  1e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  49.34 
 
 		 314 aa  310  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  49.83 
 
 		 308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  44.74 
 
 		 364 aa  295  7e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  44.72 
 
 		 318 aa  279  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  45.89 
 
 		 351 aa  278  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  44.81 
 
 		 344 aa  278  8e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  45.93 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  44.81 
 
 		 352 aa  270  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  43.23 
 
 		 351 aa  268  7e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  40.72 
 
 		 318 aa  267  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  44.26 
 
 		 351 aa  262  6e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  46.86 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  41.83 
 
 		 335 aa  258  8e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  43.77 
 
 		 335 aa  258  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  43.85 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  42.63 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  44.34 
 
 		 332 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  44.81 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  41.89 
 
 		 338 aa  252  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  42.91 
 
 		 327 aa  252  7e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  38.69 
 
 		 319 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  38.36 
 
 		 319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  38.12 
 
 		 341 aa  229  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  41.56 
 
 		 329 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  41.56 
 
 		 329 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  25.11 
 
 		 800 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  29.77 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  23.28 
 
 		 468 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 		 405 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  32.14 
 
 		 1005 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  25.33 
 
 		 354 aa  52.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 429 aa  52.8  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  23.38 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 		 422 aa  51.6  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  27.08 
 
 		 345 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 317 aa  50.4  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  28.47 
 
 		 565 aa  49.3  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 459 aa  49.3  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  29.79 
 
 		 382 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  27.97 
 
 		 391 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 1002 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  25.33 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  32.97 
 
 		 471 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 412 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  22.29 
 
 		 417 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  23.66 
 
 		 387 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0808  Radical SAM domain protein  29.89 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 1000 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  25.16 
 
 		 319 aa  46.2  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  23.16 
 
 		 440 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.57 
 
 		 308 aa  45.8  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  27.71 
 
 		 595 aa  45.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  23.66 
 
 		 387 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  27.34 
 
 		 368 aa  45.8  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1210  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 		 529 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  27.34 
 
 		 401 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  27.34 
 
 		 401 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 		 378 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  27.34 
 
 		 401 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 409 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  22.79 
 
 		 418 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  28.41 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  26.28 
 
 		 378 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1175  radical SAM domain-containing protein  33.87 
 
 		 348 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.913807  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  26.62 
 
 		 395 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0419  radical SAM domain-containing protein  36.51 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  25.17 
 
 		 480 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11698  molybdopterin biosynthesis protein moeX  25.52 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.509473 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 		 482 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, putative  27.27 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  21.71 
 
 		 497 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.85 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3791  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  27.27 
 
 		 322 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0673819 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>