24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0067 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0067  putative sodium:solute symporter, ESS family  100 
 
 
461 aa  887    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06891  sodium/solute symporter family protein  98.05 
 
 
461 aa  873    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07361  sodium/solute symporter family protein  60.54 
 
 
456 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03801  putative sodium:solute symporter, ESS family  60.61 
 
 
461 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06941  sodium/solute symporter family protein  48.92 
 
 
459 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0628  sodium/solute symporter family protein  52.53 
 
 
461 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06841  sodium/solute symporter family protein  52.3 
 
 
462 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.195837  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06551  sodium/solute symporter family protein  52.54 
 
 
462 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.40603  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2908  sodium/glutamate symporter  33.02 
 
 
470 aa  226  8e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200333  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0232  sodium/glutamate symporter  33.49 
 
 
489 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.413045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1560  sodium/glutamate symporter  31.68 
 
 
472 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000409416 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2269  sodium/glutamate symporter  32.84 
 
 
479 aa  204  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1610  sodium/glutamate symporter  31.62 
 
 
443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663624  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1785  sodium/glutamate symporter  34.33 
 
 
471 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1728  sodium/glutamate symporter  35.23 
 
 
471 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2615  sodium/glutamate symporter  35.34 
 
 
494 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00493587  normal  0.013038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0776  sodium/glutamate symporter  33.88 
 
 
462 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.278749  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02230  Na+/glutamate symporter  30.53 
 
 
459 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2370  sodium/glutamate symporter  32.71 
 
 
458 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003562  sodium/glutamate symporter  27.37 
 
 
456 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0701  sodium/glutamate symporter  26.59 
 
 
448 aa  86.7  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14970  Na+/glutamate symporter  25.25 
 
 
466 aa  81.6  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0610514  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2214  sodium/glutamate symporter  23.59 
 
 
474 aa  77  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0534  sodium/glutamate symporter  26.69 
 
 
404 aa  45.1  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>