More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0062 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0062  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 467 aa  952    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25391  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.5 
 
 		 482 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0222  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.39 
 
 		 477 aa  642    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0190  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.74 
 
 		 467 aa  662    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107102  normal  0.0279515 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03421  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.09 
 
 		 489 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06831  UDP-glucose 6-dehydrogenase  99.14 
 
 		 467 aa  944    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0865822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1312  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.21 
 
 		 474 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.277728  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14211  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.61 
 
 		 465 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.462031  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13981  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.86 
 
 		 471 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.62 
 
 		 474 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.99611  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0358  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  54.98 
 
 		 463 aa  515  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27143  predicted protein  53.96 
 
 		 471 aa  509  1e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.538639  normal  0.201769 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29766  predicted protein  53.96 
 
 		 471 aa  509  1e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0025927  hitchhiker  0.00128965 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.92 
 
 		 464 aa  500  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06460  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.58 
 
 		 468 aa  496  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2734  nucleotide sugar dehydrogenase  52.6 
 
 		 452 aa  494  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18745  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.43 
 
 		 475 aa  483  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1279  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.81 
 
 		 460 aa  451  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.29 
 
 		 443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  37.66 
 
 		 434 aa  299  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  37.01 
 
 		 433 aa  297  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  37.45 
 
 		 438 aa  297  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  37.88 
 
 		 434 aa  296  4e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  37.23 
 
 		 438 aa  295  9e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  37.23 
 
 		 456 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  37.45 
 
 		 434 aa  294  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  37.23 
 
 		 438 aa  293  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  37.58 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.64 
 
 		 438 aa  290  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  37.58 
 
 		 434 aa  290  5.0000000000000004e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  37.45 
 
 		 442 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  36.5 
 
 		 446 aa  286  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  37.23 
 
 		 441 aa  286  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  38.53 
 
 		 447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.02 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.41 
 
 		 437 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.99 
 
 		 436 aa  283  4.0000000000000003e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  35.37 
 
 		 439 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  35.85 
 
 		 440 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.25 
 
 		 438 aa  279  9e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  36.77 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.46 
 
 		 440 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.52 
 
 		 467 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.27 
 
 		 438 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  36.54 
 
 		 473 aa  276  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.31 
 
 		 434 aa  276  8e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.08 
 
 		 434 aa  272  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.62 
 
 		 434 aa  269  7e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  33.96 
 
 		 467 aa  269  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.5 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  34.27 
 
 		 440 aa  268  1e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.05 
 
 		 460 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.75 
 
 		 467 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  34.84 
 
 		 438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.85 
 
 		 438 aa  266  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.21 
 
 		 433 aa  266  8e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  36.8 
 
 		 452 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  34.34 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.97 
 
 		 466 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  35.42 
 
 		 435 aa  264  3e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.39 
 
 		 451 aa  264  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.69 
 
 		 466 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.69 
 
 		 466 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  33.82 
 
 		 470 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  34.55 
 
 		 459 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.76 
 
 		 439 aa  263  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  33.98 
 
 		 454 aa  263  6e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.2 
 
 		 436 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  33.68 
 
 		 466 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  33.69 
 
 		 466 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  34.2 
 
 		 435 aa  262  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.6 
 
 		 439 aa  262  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  34.2 
 
 		 436 aa  262  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  35.85 
 
 		 463 aa  262  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.62 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  33.76 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  36.7 
 
 		 427 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  33.62 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.47 
 
 		 466 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.9 
 
 		 448 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  34.54 
 
 		 466 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0206  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.71 
 
 		 466 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0423  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.71 
 
 		 466 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0942  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.71 
 
 		 466 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.55 
 
 		 445 aa  259  7e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2567  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.71 
 
 		 466 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  33.12 
 
 		 449 aa  259  9e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  32.91 
 
 		 470 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  33.83 
 
 		 449 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.77 
 
 		 433 aa  257  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  35.56 
 
 		 448 aa  257  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  33.83 
 
 		 449 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2941  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.5 
 
 		 466 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2988  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.5 
 
 		 466 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.7 
 
 		 457 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  34.57 
 
 		 440 aa  256  5e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.66 
 
 		 450 aa  256  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3497  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.24 
 
 		 472 aa  256  6e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.33 
 
 		 470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.42 
 
 		 435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>