More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0056 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0056  HAD family hydrolase  100 
 
 
226 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06771  phosphatase/phosphohexomutase  97.35 
 
 
226 aa  450  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18961  phosphatase/phosphohexomutase  46.26 
 
 
225 aa  205  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.452816 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15581  phosphatase/phosphohexomutase  41.47 
 
 
225 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1319  HAD family hydrolase  47.19 
 
 
219 aa  151  8e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1138  HAD family hydrolase  42.61 
 
 
216 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  35.78 
 
 
236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  34.92 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0123656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  32.38 
 
 
229 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5452  HAD-superfamily hydrolase  32.84 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  35.96 
 
 
232 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1487  putative phosphatase  37.33 
 
 
224 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.751605  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  36.54 
 
 
224 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  34.67 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  34.67 
 
 
218 aa  96.7  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  34.67 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  32.98 
 
 
218 aa  96.3  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  32.46 
 
 
220 aa  92.8  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2682  putative phosphatase  35.55 
 
 
219 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2519  putative phosphatase  35.55 
 
 
219 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0435339  normal  0.279321 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2562  putative phosphatase  35.55 
 
 
219 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166759  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2574  putative phosphatase  35.55 
 
 
219 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2474  putative phosphatase  35.55 
 
 
219 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764335  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.63 
 
 
222 aa  92  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2556  putative phosphatase  34.01 
 
 
218 aa  91.7  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  33.18 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1893  HAD family hydrolase  31.58 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13910  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  30.51 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.491881  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1197  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.43 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal  0.148864 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3432  putative phosphatase  33.63 
 
 
216 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.166368  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02218  predicted hydrolase or phosphatase  33.63 
 
 
216 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1363  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.63 
 
 
216 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0110117  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1359  putative phosphatase  33.63 
 
 
216 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35659  predicted protein  32.85 
 
 
267 aa  87.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2442  putative phosphatase  33.63 
 
 
216 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647489  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2586  putative phosphatase  33.63 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118565  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2448  putative phosphatase  33.63 
 
 
216 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.745831  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  30.81 
 
 
221 aa  87.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02178  hypothetical protein  33.63 
 
 
216 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2669  putative phosphatase  33.33 
 
 
216 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91748  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  34.81 
 
 
396 aa  87  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  30.94 
 
 
217 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.78 
 
 
223 aa  85.9  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2733  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  32.14 
 
 
237 aa  85.1  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.53567  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  30.77 
 
 
223 aa  85.1  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.98 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.11 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  30.6 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  28.64 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  28.49 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0953  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.5 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0990  HAD family hydrolase  33.5 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.480228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.43 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.022243  hitchhiker  0.00896914 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2632  HAD family hydrolase  33.5 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.88 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59029  predicted protein  29.29 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318657  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  28.8 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  29.84 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3054  HAD family hydrolase  31.79 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.751068  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.57 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  28.8 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3926  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.95 
 
 
219 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238408  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.24 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  29.65 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3906  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.95 
 
 
219 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000443869  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  30.77 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  28.7 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  30.77 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  30.65 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0931  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.53 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22053  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  27.08 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1824  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0192  beta-phosphoglucomutase  28.26 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.787129  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.98 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  28.25 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.7 
 
 
218 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000024214  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.05 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.36 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  30.43 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3473  HAD family hydrolase  29.2 
 
 
243 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  33.16 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1460  HAD family hydrolase  29.03 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00552213  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2212  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.69 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  29.9 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  27.51 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  28.04 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.21 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  28.96 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06436  hypothetical protein  27.92 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.6 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3420  HAD family hydrolase  28.65 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.964625  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1634  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.77 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1843  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.7 
 
 
241 aa  75.1  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101722  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  32.24 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3540  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.16 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.4 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.59 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>