83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0048 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0048  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 298 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.62416  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06691  hypothetical protein  97.99 
 
 		 298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18881  hypothetical protein  43.06 
 
 		 313 aa  271  9e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1327  hypothetical protein  42.43 
 
 		 330 aa  264  1e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06771  hypothetical protein  43.24 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1130  hypothetical protein  42.41 
 
 		 305 aa  263  4e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.398385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0612  hypothetical protein  42.76 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06381  hypothetical protein  41.38 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06681  hypothetical protein  42.31 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245122  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1941  hypothetical protein  37.46 
 
 		 298 aa  192  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5281  protein of unknown function DUF752  36.12 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338387 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10381  hypothetical protein  44.15 
 
 		 187 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0559  hypothetical protein  36.67 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0811  protein of unknown function DUF752  36.03 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0840  protein of unknown function DUF752  36.03 
 
 		 289 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3463  protein of unknown function DUF752  35.84 
 
 		 296 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0679006 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1778  hypothetical protein  35.23 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773906  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1730  hypothetical protein  29.67 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.8235 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0181  hypothetical protein  30.66 
 
 		 340 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1581  hypothetical protein  29.45 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0873  hypothetical protein  29.45 
 
 		 340 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.197999  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0147  hypothetical protein  27.72 
 
 		 366 aa  90.1  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.464612  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  29.73 
 
 		 500 aa  89.7  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1933  hypothetical protein  31.3 
 
 		 254 aa  88.6  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07050  hypothetical protein  26.29 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  26.87 
 
 		 564 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1235  protein of unknown function DUF752  25.55 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.887893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0764  hypothetical protein  26.27 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3099  hypothetical protein  27.11 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1833  protein of unknown function DUF752  25.43 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2146  hypothetical protein  26.67 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3563  protein of unknown function DUF752  28.38 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158975  normal  0.127143 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4769  hypothetical protein  26.73 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1456  hypothetical protein  24.26 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.439461  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0476  protein of unknown function DUF752  28.57 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0640  hypothetical protein  27.94 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000640329  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1602  protein of unknown function DUF752  26.73 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3321  hypothetical protein  24.42 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1737  hypothetical protein  25.81 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4256  hypothetical protein  22.33 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000473463  hitchhiker  0.0000809329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3871  protein of unknown function DUF752  25.71 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2850  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.73 
 
 		 644 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413253  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1871  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.38 
 
 		 672 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0302238 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1956  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  36.49 
 
 		 644 aa  50.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243551  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2519  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.22 
 
 		 679 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2539  hypothetical protein  33.78 
 
 		 266 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2586  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.6 
 
 		 675 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4488  protein of unknown function DUF752  21.05 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0144966  normal  0.226664 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1538  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.43 
 
 		 672 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0998844 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1277  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.71 
 
 		 667 aa  48.5  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0226023  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0879  hypothetical protein  30.43 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0152  protein of unknown function DUF752  31.03 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0140  hypothetical protein  33.77 
 
 		 218 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.946459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  31.63 
 
 		 677 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2432  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.08 
 
 		 678 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2336  hypothetical protein  34.25 
 
 		 218 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3932  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.88 
 
 		 656 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4486  hypothetical protein  33.93 
 
 		 241 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1208  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.24 
 
 		 612 aa  46.6  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1519  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.27 
 
 		 689 aa  46.2  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252518  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0372  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.27 
 
 		 689 aa  46.2  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000353518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1410  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.27 
 
 		 689 aa  46.2  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000203784  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1709  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  20.87 
 
 		 657 aa  45.8  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3465  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.38 
 
 		 668 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0142  hypothetical protein  28.09 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4505  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.39 
 
 		 656 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1996  fused 5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme methyltransferase and FAD-dependent demodification enzyme  26.56 
 
 		 690 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.155036  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3155  protein of unknown function DUF752  32.14 
 
 		 238 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2481  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.88 
 
 		 668 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2475  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.03 
 
 		 668 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2619  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.03 
 
 		 668 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1328  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.03 
 
 		 668 aa  43.5  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.831924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2872  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.38 
 
 		 666 aa  43.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal  0.0703666 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0147  hypothetical protein  29.58 
 
 		 227 aa  43.5  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00930427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3066  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22 
 
 		 655 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16811 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02249  hypothetical protein  27.03 
 
 		 668 aa  43.1  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.425785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02209  hypothetical protein  27.03 
 
 		 668 aa  43.1  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.334228  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2702  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.03 
 
 		 668 aa  43.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.673186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1332  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  27.03 
 
 		 668 aa  43.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3653  hypothetical protein  32.73 
 
 		 249 aa  42.7  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3369  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.68 
 
 		 673 aa  42.7  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00235092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2806  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.68 
 
 		 675 aa  42.7  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.641074  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2891  protein of unknown function DUF752  32.14 
 
 		 240 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0866147  normal  0.0591468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>