More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0034 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  97.63 
 
 
337 aa  684    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
337 aa  696    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.67 
 
 
337 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.77 
 
 
337 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.84 
 
 
337 aa  526  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10521  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.51 
 
 
337 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.167395  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.37 
 
 
338 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.07 
 
 
338 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06631  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.09 
 
 
347 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.37 
 
 
338 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.46 
 
 
336 aa  454  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.96 
 
 
355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.69 
 
 
336 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.69 
 
 
336 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.76 
 
 
337 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.96 
 
 
339 aa  439  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4670  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.36 
 
 
335 aa  428  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.406133  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.66 
 
 
335 aa  428  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  58.24 
 
 
342 aa  411  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15595  predicted protein  48.74 
 
 
360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 
348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 
334 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 
327 aa  326  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1560  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
341 aa  325  5e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.206839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 
336 aa  322  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.11 
 
 
335 aa  322  5e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4871  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
337 aa  318  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178107  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
327 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1239  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 
344 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.244694 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13369  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
336 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
339 aa  311  7.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
336 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1212  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 
344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1229  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 
344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 
344 aa  308  8e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0801  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 
332 aa  307  1.0000000000000001e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.154827  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
354 aa  306  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0216  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 
347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
347 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1087  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 
329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0214657  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
338 aa  302  4.0000000000000003e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
346 aa  301  7.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
346 aa  301  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
346 aa  301  9e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
350 aa  301  9e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 
328 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2020  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
336 aa  301  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000713321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
329 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1099  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
329 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
329 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1075  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
329 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
329 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0338  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 
353 aa  300  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 
353 aa  300  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
329 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 
331 aa  300  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
350 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1122  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 
347 aa  299  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.432931  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 
329 aa  299  5e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
328 aa  299  5e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
334 aa  299  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
334 aa  299  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
332 aa  298  7e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
329 aa  298  7e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1010  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 
351 aa  298  8e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
332 aa  298  8e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0741  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
341 aa  298  9e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0159074  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
329 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
332 aa  297  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
332 aa  297  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
332 aa  297  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
332 aa  297  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
332 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
338 aa  297  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 
357 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0370  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 
353 aa  297  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0360  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 
344 aa  296  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 
357 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
339 aa  296  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.502429 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 
334 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 
334 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
365 aa  295  5e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 
334 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 
334 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 
334 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 
348 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0574  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
332 aa  296  5e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
350 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
334 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03188  hypothetical protein  45.07 
 
 
334 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
334 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.449952  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3660  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
334 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0133889 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0110  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 
333 aa  294  1e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0614  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
332 aa  294  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.788097  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
333 aa  294  1e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3557  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 
352 aa  295  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4688  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
334 aa  295  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.79843  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>