79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0028 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18471  lipase family protein  50.83 
 
 		 206 aa  204  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1028  lipase family protein  47.09 
 
 		 191 aa  194  6e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.508866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0929  lipase family protein  46.32 
 
 		 195 aa  191  5e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10581  lipase family protein  45.21 
 
 		 191 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.565491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  45.41 
 
 		 203 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  40.93 
 
 		 197 aa  171  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  44.27 
 
 		 197 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  43.37 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  31.82 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  29.9 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  30.93 
 
 		 195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  30.93 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  28.42 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  29.38 
 
 		 191 aa  91.7  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  32.47 
 
 		 194 aa  87.8  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  30.27 
 
 		 192 aa  87.8  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  34.42 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  23.24 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  26.49 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  28.16 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  27.43 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  27.16 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  28.07 
 
 		 286 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  25.81 
 
 		 313 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  25.87 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  24.86 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  26.88 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  25.13 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  26.44 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  31.82 
 
 		 334 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  25.99 
 
 		 269 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  27.27 
 
 		 342 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3837  hypothetical protein  27.5 
 
 		 455 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  25.14 
 
 		 361 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  25.53 
 
 		 304 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  26.8 
 
 		 287 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  27.46 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  25.49 
 
 		 287 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  23.68 
 
 		 283 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  25.49 
 
 		 287 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  25.6 
 
 		 302 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0578  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 294 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  25.12 
 
 		 285 aa  46.2  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  25.83 
 
 		 249 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.09 
 
 		 286 aa  46.2  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  23.33 
 
 		 332 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1108  hypothetical protein  22.36 
 
 		 293 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1567  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  26.55 
 
 		 275 aa  45.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  23.63 
 
 		 302 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1542  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.27 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  26.49 
 
 		 356 aa  44.7  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0628  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  26.61 
 
 		 270 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  21.79 
 
 		 282 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 318 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.72 
 
 		 273 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 318 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 318 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  23.3 
 
 		 281 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  27.03 
 
 		 303 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1181  acetyltransferase or hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  27.64 
 
 		 268 aa  43.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.899858  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  28.83 
 
 		 303 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  27.68 
 
 		 240 aa  42.7  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  23.93 
 
 		 349 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1108  hypothetical protein  21.74 
 
 		 293 aa  42  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  23.93 
 
 		 311 aa  42  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  23.93 
 
 		 296 aa  42  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  23.93 
 
 		 311 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03084  lipase/serine esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12320)  28.77 
 
 		 465 aa  42  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.855858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  23.93 
 
 		 296 aa  42  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  23.93 
 
 		 296 aa  42  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  23.93 
 
 		 296 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2103  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 		 296 aa  41.6  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 325 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  27.82 
 
 		 236 aa  41.2  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  21.99 
 
 		 286 aa  41.2  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 353 aa  41.2  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>