80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0027 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0027  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
129 aa  260  4e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06471  dihydroneopterin aldolase  99.22 
 
 
129 aa  259  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.147381  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0928  dihydroneopterin aldolase family protein  52.89 
 
 
124 aa  136  8.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18461  dihydroneopterin aldolase  54.55 
 
 
127 aa  135  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.795038 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1027  dihydroneopterin aldolase  48.72 
 
 
123 aa  127  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.657456  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10591  dihydroneopterin aldolase  50.85 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279574  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06171  dihydroneopterin aldolase  42.48 
 
 
120 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0591  dihydroneopterin aldolase  44.95 
 
 
120 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.503596  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06561  dihydroneopterin aldolase  43.24 
 
 
120 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06471  dihydroneopterin aldolase  41.44 
 
 
120 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1072  dihydroneopterin aldolase  35.54 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000958516 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1428  dihydroneopterin aldolase  31.93 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0687  dihydroneopterin aldolase  33.05 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0921  dihydroneopterin aldolase  26.27 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.294269  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0040  dihydroneopterin aldolase dihydroneopterin aldolase  27.12 
 
 
125 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  27.19 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0444  dihydroneopterin aldolase  29.82 
 
 
118 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  29.75 
 
 
126 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0457  dihydroneopterin aldolase  29.82 
 
 
118 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.660964  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  28.21 
 
 
120 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  27.97 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000922875 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  25.66 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1499  dihydroneopterin aldolase  29.66 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115418  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0154  dihydroneopterin aldolase  28.07 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867161  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  28.21 
 
 
120 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1880  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  30.63 
 
 
276 aa  51.2  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  28.93 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  29.17 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1513  dihydroneopterin aldolase  25 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  27.35 
 
 
122 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  24.39 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  29.17 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  29.17 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  29.17 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000108398 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  29.17 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1675  dihydroneopterin aldolase  29 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0522559 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1274  dihydroneopterin aldolase  32.76 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.436023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  29.17 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2194  dihydroneopterin aldolase  22.52 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343507  normal  0.0385809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2043  dihydroneopterin aldolase  35.11 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  29.17 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2091  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
117 aa  49.7  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.951918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1931  dihydroneopterin aldolase  35.87 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190594  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27090  dihydroneopterin aldolase  26.23 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3534  dihydroneopterin aldolase  35.87 
 
 
125 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0920565  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3025  dihydroneopterin aldolase (DHNA)  34.04 
 
 
122 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12830  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  33.33 
 
 
305 aa  47  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0897405  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0761  dihydroneopterin aldolase  28.3 
 
 
122 aa  47  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.811624  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2294  dihydroneopterin aldolase  27.12 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.779597  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2349  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0828441  normal  0.0512574 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2191  dihydroneopterin aldolase  24.76 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0070  dihydroneopterin aldolase  24.58 
 
 
126 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  27.36 
 
 
131 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1044  dihydroneopterin aldolase  23.53 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00112146  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1764  dihydroneopterin aldolase  35.87 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1032  dihydroneopterin aldolase  26.96 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2140  dihydroneopterin aldolase  24.07 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0316  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.17709  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  27.35 
 
 
120 aa  45.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  25.44 
 
 
292 aa  44.7  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13639  dihydroneopterin aldolase folB  34 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  hitchhiker  0.00236264 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  25 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0541  dihydroneopterin aldolase  30.11 
 
 
137 aa  43.5  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2568  dihydroneopterin aldolase  25.71 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  30.43 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  29.35 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5982  dihydroneopterin aldolase  25.22 
 
 
122 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102976  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0096  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
123 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4785  dihydroneopterin aldolase  27.18 
 
 
144 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0888028  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1331  dihydroneopterin aldolase  26.92 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.951458  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4853  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4767  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  24.42 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2247  dihydroneopterin aldolase  27.18 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5153  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5757  dihydroneopterin aldolase  38.46 
 
 
126 aa  40.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.608732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0512  dihydroneopterin aldolase  25 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  22.69 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0269  dihydroneopterin aldolase family protein  23.81 
 
 
125 aa  40.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8421  dihydroneopterin aldolase  23.08 
 
 
147 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>