More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_89936 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  100 
 
 
793 aa  1642    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00990  Endoribonuclease ysh1 (EC 3.1.27.-)(mRNA 3'-end-processing protein ysh1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BEP0]  44.46 
 
 
884 aa  613  9.999999999999999e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02710  hypothetical protein  40.87 
 
 
773 aa  532  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  43.18 
 
 
767 aa  460  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  39.29 
 
 
602 aa  462  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  30.74 
 
 
636 aa  203  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  29.25 
 
 
426 aa  191  7e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  29.88 
 
 
639 aa  188  3e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  29.62 
 
 
422 aa  188  4e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 
422 aa  187  8e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 
422 aa  187  8e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 
821 aa  182  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  27.96 
 
 
635 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 
642 aa  178  4e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  29.29 
 
 
635 aa  178  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  28.83 
 
 
635 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  28.83 
 
 
635 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 
421 aa  174  5e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  28.77 
 
 
635 aa  173  9e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 
640 aa  173  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 
635 aa  173  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  26.43 
 
 
640 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 
635 aa  171  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  27.92 
 
 
635 aa  169  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  28.54 
 
 
636 aa  169  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 
634 aa  167  5e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  26.65 
 
 
639 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 
641 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  26.68 
 
 
630 aa  162  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  25.96 
 
 
455 aa  162  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  26.91 
 
 
433 aa  161  5e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.11 
 
 
636 aa  161  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 
433 aa  160  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 
433 aa  160  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  25.56 
 
 
644 aa  159  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 
433 aa  159  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 
641 aa  159  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  27.29 
 
 
647 aa  157  8e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 
634 aa  157  9e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 
830 aa  156  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 
630 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  25.35 
 
 
644 aa  155  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  25.61 
 
 
637 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  24.72 
 
 
646 aa  152  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3425  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.5 
 
 
451 aa  152  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  25.39 
 
 
451 aa  152  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  26.14 
 
 
447 aa  149  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  26.1 
 
 
441 aa  149  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.21 
 
 
454 aa  148  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.68 
 
 
410 aa  147  7.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 
425 aa  147  9e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  25.73 
 
 
629 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  26.73 
 
 
589 aa  144  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  25.33 
 
 
453 aa  144  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  25.79 
 
 
536 aa  144  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  25.88 
 
 
432 aa  144  7e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  26.22 
 
 
472 aa  144  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  26.22 
 
 
472 aa  144  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  26.22 
 
 
472 aa  144  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  26 
 
 
472 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  25.67 
 
 
634 aa  143  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  26.06 
 
 
468 aa  143  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  26.29 
 
 
459 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  26.35 
 
 
468 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  26 
 
 
603 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  25.16 
 
 
524 aa  141  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1945  beta-lactamase domain protein  25.61 
 
 
461 aa  141  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000813618 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1883  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 
456 aa  140  8.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1566  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 
441 aa  139  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0665026  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  26.3 
 
 
467 aa  138  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25.93 
 
 
432 aa  138  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.41 
 
 
465 aa  137  5e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25.73 
 
 
540 aa  137  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 
454 aa  137  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  24.63 
 
 
542 aa  137  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 
462 aa  137  9e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 
465 aa  136  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  24.44 
 
 
454 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  26.94 
 
 
454 aa  136  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  25.06 
 
 
472 aa  136  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  25.17 
 
 
454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25.17 
 
 
541 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  27.91 
 
 
464 aa  135  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  26.19 
 
 
461 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  27.77 
 
 
465 aa  135  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  27.04 
 
 
411 aa  135  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5620  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 
473 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2716  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 
481 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.521064 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  25.44 
 
 
462 aa  134  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  25.44 
 
 
462 aa  134  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3061  hypothetical protein  24.37 
 
 
533 aa  134  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  25.81 
 
 
455 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  25.37 
 
 
540 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  24.28 
 
 
470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  25.81 
 
 
470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  24.77 
 
 
464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  26.96 
 
 
455 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 
462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 
428 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  24.08 
 
 
467 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>