226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_87778 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_87778  dihydrosphingosine-1-phosphate lyase  100 
 
 		 603 aa  1242    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01989  conserved hypothetical protein similar to dihydrosphingosine phosphate lyase (Eurofung)  47.71 
 
 		 572 aa  527  1e-148  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.108973 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00560  sphinganine-1-phosphate aldolase, putative  40.61 
 
 		 546 aa  417  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1867  pyridoxal-dependent decarboxylase  38.88 
 
 		 498 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2597  pyridoxal-dependent decarboxylase  40.12 
 
 		 498 aa  354  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3073  Pyridoxal-dependent decarboxylase  36.99 
 
 		 514 aa  348  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.441347  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15730  predicted protein  37.31 
 
 		 442 aa  314  3.9999999999999997e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0024811  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119543  Sphingosine-1-phosphate lyase  36.36 
 
 		 532 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0309  sphingosine-1-phosphate lyase  38.12 
 
 		 473 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0311  sphingosine-1-phosphate lyase  37.05 
 
 		 473 aa  299  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0935746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2756  sphingosine-1-phosphate lyase  36.67 
 
 		 473 aa  296  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2912  sphingosine-1-phosphate lyase  37.1 
 
 		 473 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0389716  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2562  Pyridoxal-dependent decarboxylase  38.51 
 
 		 468 aa  292  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000400331  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0159  Pyridoxal-dependent decarboxylase  33.7 
 
 		 513 aa  291  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1139  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  35.99 
 
 		 473 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.428342  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2918  sphingosine-1-phosphate lyase  37.96 
 
 		 485 aa  287  5e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1143  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  37.71 
 
 		 473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764219  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2761  sphingosine-1-phosphate lyase  37.71 
 
 		 498 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0806  pyridoxal-dependent decarboxylase  35.18 
 
 		 411 aa  256  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2190  pyridoxal-dependent decarboxylase  35.96 
 
 		 474 aa  249  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1072  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.62 
 
 		 474 aa  243  7.999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3961  Pyridoxal-dependent decarboxylase  33.99 
 
 		 478 aa  238  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22660  PLP-dependent enzyme, glutamate decarboxylase  34.09 
 
 		 483 aa  231  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1500  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.89 
 
 		 500 aa  226  1e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.112242  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2128  hypothetical protein  31.23 
 
 		 605 aa  221  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2102  hypothetical protein  31.57 
 
 		 605 aa  218  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1873  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.58 
 
 		 472 aa  217  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.044289  normal  0.812242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3418  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.05 
 
 		 472 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.3739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0389  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.45 
 
 		 499 aa  200  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3373  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.7 
 
 		 494 aa  196  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0563875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3771  Pyridoxal-dependent decarboxylase  34.27 
 
 		 464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0013231  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.58 
 
 		 500 aa  177  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1646  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.72 
 
 		 531 aa  176  8e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.360042  hitchhiker  0.00112571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0451  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.19 
 
 		 425 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3997  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.24 
 
 		 516 aa  170  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167245  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1636  L-tyrosine decarboxylase  29.51 
 
 		 384 aa  160  8e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0977  L-tyrosine decarboxylase  29.47 
 
 		 395 aa  148  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1732  L-tyrosine decarboxylase  29.39 
 
 		 379 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2007  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.9 
 
 		 403 aa  132  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1545  L-tyrosine decarboxylase  26.63 
 
 		 365 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0671702  hitchhiker  0.0000867545 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1848  L-tyrosine decarboxylase  29.17 
 
 		 365 aa  124  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2080  L-tyrosine decarboxylase  29.65 
 
 		 363 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1766  glutamate decarboxylase  25.54 
 
 		 460 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3467  glutamate decarboxylase  24.23 
 
 		 457 aa  118  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.43113  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2611  L-tyrosine decarboxylase  28.3 
 
 		 369 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1616  glutamate decarboxylase  25.84 
 
 		 488 aa  116  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170706  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1145  glutamate decarboxylase  25.58 
 
 		 461 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1162  glutamate decarboxylase  25.58 
 
 		 461 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.824661 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1172  glutamate decarboxylase  25.58 
 
 		 461 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615591  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2029  glutamate decarboxylase  24.17 
 
 		 466 aa  114  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2166  L-tyrosine decarboxylase  30.66 
 
 		 365 aa  114  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1436  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.32 
 
 		 374 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.687898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2315  glutamate decarboxylase  23.11 
 
 		 464 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1008  L-tyrosine decarboxylase  28.12 
 
 		 390 aa  110  6e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.461391  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1136  L-tyrosine decarboxylase  28.35 
 
 		 384 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1130  L-tyrosine decarboxylase  28.81 
 
 		 384 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0372  glutamate decarboxylase  25.65 
 
 		 466 aa  107  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13469  glutamate decarboxylase gadB  25.91 
 
 		 460 aa  107  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.294595  hitchhiker  0.000990947 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0551  glutamate decarboxylase  23.33 
 
 		 461 aa  107  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1483  glutamate decarboxylase  25.63 
 
 		 463 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0821  L-tyrosine decarboxylase  28.25 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.750414  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0045  glutamate decarboxylase  24.48 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1547  L-tyrosine decarboxylase  29.38 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.875736  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07278  glutamate decarboxylase (Eurofung)  24.23 
 
 		 521 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3826  glutamate decarboxylase  23.2 
 
 		 461 aa  105  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18041  glutamate decarboxylase  23.54 
 
 		 479 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.171895 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4935  glutamate decarboxylase  24.59 
 
 		 468 aa  104  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2744  glutamate decarboxylase  25 
 
 		 468 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0749502  hitchhiker  0.000505067 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2953  glutamate decarboxylase  23.22 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4739  glutamate decarboxylase  22.93 
 
 		 464 aa  102  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1197  glutamate decarboxylase beta  23.63 
 
 		 464 aa  100  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05447  hypothetical glutamic acid decarboxylase (Eurofung)  22.6 
 
 		 515 aa  100  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6904  glutamate decarboxylase  24.74 
 
 		 473 aa  99.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0309  glutamate decarboxylase  24.78 
 
 		 455 aa  98.6  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0520233  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03063  glutamate decarboxylase  23.42 
 
 		 464 aa  97.8  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2691  glutamate decarboxylase  24.72 
 
 		 489 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0236488  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3820  glutamate decarboxylase GadB  23.89 
 
 		 466 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01451  glutamate decarboxylase B, PLP-dependent  24.34 
 
 		 466 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03365  glutamate decarboxylase A, PLP-dependent  24.34 
 
 		 466 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0196  glutamate decarboxylase  24.34 
 
 		 466 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2153  glutamate decarboxylase  24.34 
 
 		 466 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.139052  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0181  glutamate decarboxylase  23.55 
 
 		 466 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3720  glutamate decarboxylase GadA  24.34 
 
 		 466 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01464  hypothetical protein  24.34 
 
 		 466 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0200  glutamate decarboxylase  24.34 
 
 		 466 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.718769 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2164  glutamate decarboxylase  24.34 
 
 		 466 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.19141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1756  glutamate decarboxylase GadB  24.34 
 
 		 466 aa  95.1  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.347541  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2106  glutamate decarboxylase GadA  24.34 
 
 		 466 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4005  glutamate decarboxylase  24.34 
 
 		 466 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1680  glutamate decarboxylase GadA  24.34 
 
 		 466 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1682  glutamate decarboxylase GadB  24.34 
 
 		 466 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03318  hypothetical protein  24.34 
 
 		 466 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4879  glutamate decarboxylase GadB  24.34 
 
 		 466 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1578  glutamate decarboxylase GadB  24.34 
 
 		 466 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40180  Glutamate decarboxylase (GAD) (ERT D1)  24.79 
 
 		 569 aa  94.4  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1640  glutamate decarboxylase  23.68 
 
 		 470 aa  91.3  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5339  glutamate decarboxylase  22.66 
 
 		 468 aa  89.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03700  glutamate decarboxylase, putative  23.53 
 
 		 557 aa  89  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03700  glutamate decarboxylase, putative  23.53 
 
 		 557 aa  89  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4374  glutamate decarboxylase  21.05 
 
 		 466 aa  87.4  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.777962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>