125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_87371 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  100 
 
 		 257 aa  522  1e-147  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  75.31 
 
 		 246 aa  381  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  70.71 
 
 		 270 aa  342  4e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  66.1 
 
 		 245 aa  320  1.9999999999999998e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  61.48 
 
 		 237 aa  284  8e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  44.35 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  41.42 
 
 		 249 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  44.5 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  43.33 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  43.33 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  45.58 
 
 		 240 aa  188  7e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  40.98 
 
 		 249 aa  188  8e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  43.58 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  44.59 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  42.92 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  43.12 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  45 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  43.89 
 
 		 259 aa  184  9e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  42.6 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  42.62 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  42.22 
 
 		 239 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  43.12 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  43.98 
 
 		 271 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  41.07 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  41.92 
 
 		 243 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  38.4 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  43.12 
 
 		 251 aa  175  8e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  43.58 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  42.79 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  42.2 
 
 		 242 aa  172  5e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  42.2 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  43.12 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  39.66 
 
 		 267 aa  168  7e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  40.83 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  37.65 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  40.37 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  38.34 
 
 		 255 aa  165  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  41.71 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  37.45 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  33.88 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  33.7 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  35.44 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  36.06 
 
 		 289 aa  149  3e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  36.99 
 
 		 240 aa  148  7e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  37.04 
 
 		 264 aa  145  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  34.69 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  32.34 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  32.21 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  32.46 
 
 		 235 aa  136  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  33.47 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  31.97 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  34.09 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  29.8 
 
 		 252 aa  128  8.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  36.23 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  33.62 
 
 		 233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  38.38 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  37.62 
 
 		 280 aa  125  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  38.38 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  29.84 
 
 		 254 aa  123  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  36.51 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  32.31 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  33.63 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  27.27 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.220218 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  33.17 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  28.86 
 
 		 247 aa  112  9e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  31.88 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  25.93 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  29.86 
 
 		 236 aa  95.9  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  31.88 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  26.64 
 
 		 238 aa  89  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  27.1 
 
 		 210 aa  85.1  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  28.78 
 
 		 200 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  28.57 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  31.84 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  27.64 
 
 		 201 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  28.85 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  28.8 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  29.12 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  27.72 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  26.92 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  26.13 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  32.96 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  26.37 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  25.13 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  24.89 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  27.93 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  30.73 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  26.13 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  26.13 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  25.68 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  27.01 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  23.7 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  24.57 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  23.08 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29.65 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.13 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  29.05 
 
 		 213 aa  62  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  27.75 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  25.24 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  27.54 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>