More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_86849 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03657  putative TeaA receptor TeaR (Eurofung)  52.39 
 
 		 1015 aa  1047    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.902934 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86849  3'-5' exoribonuclease required for 3 end formation of 5.8S rRNA  100 
 
 		 989 aa  2044    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.188778  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00800  conserved hypothetical protein  47.21 
 
 		 1002 aa  888    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.123934  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43971  predicted protein  40.45 
 
 		 962 aa  652    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23306  predicted protein  38.41 
 
 		 908 aa  586  1e-166  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.103886  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_10027  predicted protein  34.33 
 
 		 668 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000299968  normal  0.0425653 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02350  SSD1 protein, putative  29.23 
 
 		 1671 aa  292  3e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_582  predicted protein  36.46 
 
 		 538 aa  277  7e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000266967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  34.93 
 
 		 709 aa  267  8.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  31.82 
 
 		 750 aa  259  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  34.38 
 
 		 795 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26775  predicted protein  32.23 
 
 		 593 aa  256  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12421  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0830  ribonuclease R  33.52 
 
 		 742 aa  254  4.0000000000000004e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  33.23 
 
 		 751 aa  253  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03430  putative exoribonuclease  31.28 
 
 		 735 aa  252  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  32.88 
 
 		 770 aa  248  4e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  32.64 
 
 		 702 aa  248  4.9999999999999997e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1319  hypothetical protein  33.16 
 
 		 718 aa  243  2e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.815351 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  32.08 
 
 		 795 aa  241  5.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  32.36 
 
 		 762 aa  241  6.999999999999999e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1017  ribonuclease R  30.83 
 
 		 726 aa  240  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  32.42 
 
 		 791 aa  239  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  31.74 
 
 		 795 aa  239  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  32.7 
 
 		 825 aa  238  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  32.73 
 
 		 705 aa  238  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  32.93 
 
 		 794 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  33.09 
 
 		 716 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  32.43 
 
 		 791 aa  231  6e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01158  cell wall biogenesis protein phosphatase Ssd1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11420)  26.51 
 
 		 1374 aa  228  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  30.22 
 
 		 766 aa  221  3.9999999999999997e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  31.54 
 
 		 706 aa  221  6e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  29.86 
 
 		 813 aa  218  5.9999999999999996e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  30.34 
 
 		 812 aa  217  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  30.61 
 
 		 806 aa  217  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  30.61 
 
 		 806 aa  217  9e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  30.61 
 
 		 808 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  30.61 
 
 		 804 aa  217  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  30.61 
 
 		 810 aa  217  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  30.61 
 
 		 808 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  30.61 
 
 		 808 aa  217  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  30.42 
 
 		 806 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  31.07 
 
 		 863 aa  215  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  30.99 
 
 		 792 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  29.96 
 
 		 814 aa  214  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  32.01 
 
 		 710 aa  214  9e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  30.07 
 
 		 704 aa  213  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  31.85 
 
 		 710 aa  213  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  29.71 
 
 		 757 aa  210  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  30.87 
 
 		 709 aa  210  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  30.32 
 
 		 762 aa  210  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  30.69 
 
 		 758 aa  210  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  30.35 
 
 		 790 aa  209  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  30.35 
 
 		 790 aa  209  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  31.43 
 
 		 788 aa  207  9e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  28.47 
 
 		 759 aa  207  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  31.84 
 
 		 705 aa  207  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  29.66 
 
 		 1182 aa  204  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  29.63 
 
 		 763 aa  204  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  30.18 
 
 		 801 aa  202  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  31.25 
 
 		 801 aa  202  3.9999999999999996e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  29.73 
 
 		 752 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  30.83 
 
 		 817 aa  200  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  29.7 
 
 		 903 aa  199  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  27.94 
 
 		 792 aa  198  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  29.88 
 
 		 695 aa  197  8.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  31.13 
 
 		 751 aa  196  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  28.51 
 
 		 810 aa  196  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  30.87 
 
 		 751 aa  195  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  27.92 
 
 		 701 aa  194  7e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  29.31 
 
 		 737 aa  192  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  29.82 
 
 		 763 aa  191  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  29.04 
 
 		 706 aa  189  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  28.98 
 
 		 715 aa  187  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  31.48 
 
 		 619 aa  186  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0050  ribonuclease R  31.09 
 
 		 750 aa  185  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  29.91 
 
 		 667 aa  184  7e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  27.26 
 
 		 770 aa  183  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1126  RNAse R  30.93 
 
 		 752 aa  183  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  29.25 
 
 		 692 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0037  ribonuclease R  30.68 
 
 		 745 aa  182  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2787  ribonuclease R  31.02 
 
 		 752 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1646  ribonuclease R  30.65 
 
 		 781 aa  181  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.353487 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2853  ribonuclease R  29.58 
 
 		 754 aa  180  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  29.07 
 
 		 694 aa  179  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  29.17 
 
 		 758 aa  179  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  31.52 
 
 		 665 aa  179  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6672  ribonuclease R  29.55 
 
 		 762 aa  178  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.594925 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  27.93 
 
 		 805 aa  177  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1386  ribonuclease R  29.86 
 
 		 790 aa  177  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.365928 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  29.34 
 
 		 770 aa  177  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7411  ribonuclease R  28.37 
 
 		 762 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00900108  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2994  RNAse R  30.63 
 
 		 761 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  29.16 
 
 		 737 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  26.53 
 
 		 907 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  29.35 
 
 		 726 aa  176  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  29.22 
 
 		 737 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3536  ribonuclease R  31.77 
 
 		 781 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589347  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  27.02 
 
 		 749 aa  175  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  28.32 
 
 		 736 aa  175  5e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0915  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  28.87 
 
 		 756 aa  174  5.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>