More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_81386 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  72.12 
 
 		 568 aa  831    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  71.12 
 
 		 558 aa  810    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  59.7 
 
 		 542 aa  663    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  100 
 
 		 553 aa  1120    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  58.51 
 
 		 551 aa  625  1e-178  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  41.43 
 
 		 545 aa  397  1e-109  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  39.14 
 
 		 570 aa  365  1e-99  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  38.75 
 
 		 557 aa  365  2e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  39.2 
 
 		 553 aa  363  6e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  39.09 
 
 		 551 aa  362  8e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  39.54 
 
 		 563 aa  361  2e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  39.66 
 
 		 543 aa  361  2e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  38.33 
 
 		 559 aa  348  1e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  37.14 
 
 		 543 aa  347  4e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  36.43 
 
 		 555 aa  346  6e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  38.64 
 
 		 558 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  40.08 
 
 		 551 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  37.31 
 
 		 554 aa  343  4e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  38.67 
 
 		 540 aa  343  5e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  37.31 
 
 		 542 aa  342  9e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  39.28 
 
 		 552 aa  341  2e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  38.78 
 
 		 557 aa  342  2e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  35.67 
 
 		 543 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  38.4 
 
 		 559 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  36.76 
 
 		 543 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  38.52 
 
 		 548 aa  336  7.999999999999999e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  37.5 
 
 		 539 aa  335  1e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  36.93 
 
 		 553 aa  334  2e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  39.09 
 
 		 550 aa  333  4e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  38.52 
 
 		 547 aa  333  6e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  39.39 
 
 		 549 aa  331  2e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  36.93 
 
 		 554 aa  331  2e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  35.66 
 
 		 558 aa  331  2e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  39.7 
 
 		 553 aa  331  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  37.95 
 
 		 560 aa  331  2e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  37.12 
 
 		 560 aa  332  2e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  36 
 
 		 545 aa  330  3e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  38.25 
 
 		 551 aa  330  3e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  36 
 
 		 542 aa  329  7e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  35.62 
 
 		 542 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  36.55 
 
 		 558 aa  327  5e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  39.16 
 
 		 558 aa  325  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  39.06 
 
 		 554 aa  325  1e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  37.13 
 
 		 562 aa  324  3e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  35.61 
 
 		 570 aa  323  6e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  36.24 
 
 		 552 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  37.5 
 
 		 553 aa  320  6e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  38.56 
 
 		 552 aa  318  1e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  37.7 
 
 		 541 aa  318  1e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  35.19 
 
 		 537 aa  313  5.999999999999999e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  34.41 
 
 		 554 aa  311  2e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  36.67 
 
 		 536 aa  310  5.9999999999999995e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  35.35 
 
 		 555 aa  306  9.000000000000001e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  35.48 
 
 		 532 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  36.57 
 
 		 530 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  34.79 
 
 		 561 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  35.36 
 
 		 548 aa  301  2e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  33.33 
 
 		 542 aa  293  5e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  34.34 
 
 		 560 aa  293  8e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.66 
 
 		 528 aa  292  9e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.48 
 
 		 529 aa  292  1e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  33.52 
 
 		 563 aa  290  4e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  34.4 
 
 		 577 aa  290  5.0000000000000004e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  35.2 
 
 		 546 aa  288  2e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  33.33 
 
 		 547 aa  286  7e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.7 
 
 		 527 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  34.01 
 
 		 500 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.64 
 
 		 525 aa  280  6e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.96 
 
 		 519 aa  276  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  33.27 
 
 		 530 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.316899 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  31.7 
 
 		 538 aa  272  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  32.46 
 
 		 523 aa  263  4.999999999999999e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  32.42 
 
 		 553 aa  263  6e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  32.42 
 
 		 553 aa  263  6e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  33.46 
 
 		 535 aa  260  4e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  32.83 
 
 		 535 aa  260  6e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.03 
 
 		 525 aa  259  7e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  33.15 
 
 		 531 aa  258  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  30.44 
 
 		 567 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  32.7 
 
 		 528 aa  250  4e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  31.18 
 
 		 559 aa  249  7e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  33.02 
 
 		 527 aa  249  9e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  30.04 
 
 		 527 aa  249  9e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363344 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  31.39 
 
 		 536 aa  244  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  32.71 
 
 		 526 aa  243  5e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  30.38 
 
 		 536 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  29.61 
 
 		 529 aa  233  5e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  30.68 
 
 		 548 aa  232  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  31.95 
 
 		 550 aa  231  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  28.52 
 
 		 552 aa  231  3e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  31.05 
 
 		 533 aa  227  4e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  29.8 
 
 		 541 aa  224  4e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  30.23 
 
 		 527 aa  224  4e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  28.51 
 
 		 539 aa  221  3.9999999999999997e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  30.35 
 
 		 541 aa  218  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  28.19 
 
 		 558 aa  213  7.999999999999999e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  30.02 
 
 		 548 aa  208  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  30.8 
 
 		 546 aa  204  5e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  28.63 
 
 		 534 aa  200  5e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  28.63 
 
 		 534 aa  200  5e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>