More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_81289 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_81289  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
776 aa  1609  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  unclonable  3.12189e-07 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00900  cysteine-tRNA ligase, putative  45.73 
 
 
785 aa  629  1e-179  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.151967  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08800  cysteinyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G09610)  39.43 
 
 
833 aa  536  1e-151  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.514684  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34104  predicted protein  39.1 
 
 
746 aa  450  1e-125  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.121587 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26346  predicted protein  40.37 
 
 
647 aa  370  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.607128  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
476 aa  243  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 
476 aa  231  3e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  9.06806e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 
476 aa  231  5e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1376  cysteinyl-tRNA synthetase  31.32 
 
 
479 aa  223  8e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0031117  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
493 aa  213  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 
475 aa  213  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0635  cysteinyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 
457 aa  211  4e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 
487 aa  211  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
466 aa  209  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  4.47814e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
494 aa  210  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 
493 aa  208  3e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  3.33718e-05 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
474 aa  207  4e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 
466 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 
470 aa  206  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  30.72 
 
 
466 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 
480 aa  205  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  35.94 
 
 
480 aa  206  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 
485 aa  205  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
485 aa  204  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
485 aa  203  8e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
465 aa  203  1e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.05277e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 
447 aa  202  2e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
481 aa  201  4e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  33.16 
 
 
497 aa  201  4e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
470 aa  201  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 
473 aa  200  7e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 
499 aa  200  7e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  31.67 
 
 
468 aa  199  1e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 
460 aa  198  2e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
461 aa  199  2e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  3.07026e-05 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
498 aa  198  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  8.39474e-10 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
448 aa  198  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0061  cysteinyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
474 aa  197  4e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.63624  normal  0.0841758 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
474 aa  198  4e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 
458 aa  197  4e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 
500 aa  197  5e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  3.51954e-08  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1108  cysteinyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
473 aa  197  6e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.917766  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
447 aa  197  6e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  30 
 
 
459 aa  197  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 
467 aa  197  7e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 
461 aa  196  9e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2496  cysteinyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 
482 aa  197  9e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.499432  decreased coverage  0.000437171 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 
468 aa  197  9e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0065  cysteinyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 
476 aa  197  9e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
461 aa  196  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 
483 aa  195  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 
465 aa  195  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
481 aa  195  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
466 aa  194  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 
472 aa  194  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13051  cysteinyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 
492 aa  194  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
462 aa  193  9e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  32 
 
 
460 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1915  cysteinyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
458 aa  193  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 
477 aa  193  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.44083e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 
486 aa  193  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
460 aa  193  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  31.67 
 
 
460 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 
468 aa  192  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 
486 aa  192  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2683  cysteinyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
481 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025433  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2590  cysteinyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
481 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0727872  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1888  cysteinyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
464 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.298729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 
465 aa  192  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
458 aa  192  3e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01977  cysteinyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 
460 aa  191  3e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1273  cysteinyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
481 aa  192  3e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 
465 aa  192  3e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
460 aa  192  3e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 
465 aa  192  3e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 
465 aa  192  3e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 
465 aa  192  3e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.57643e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
457 aa  192  3e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 
465 aa  192  3e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 
465 aa  192  3e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 
466 aa  191  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
460 aa  191  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 
466 aa  191  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
463 aa  191  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 
485 aa  191  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
493 aa  191  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
460 aa  191  6e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  4.55216e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 
460 aa  191  6e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
460 aa  191  6e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
459 aa  190  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  31.87 
 
 
488 aa  190  8e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
460 aa  189  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
460 aa  190  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
460 aa  189  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 
466 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
487 aa  189  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4314  cysteinyl-tRNA synthetase  30.53 
 
 
467 aa  189  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
485 aa  189  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 
460 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 
484 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>