251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_76567 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  100 
 
 
242 aa  494  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  49.57 
 
 
326 aa  202  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  48.54 
 
 
254 aa  184  8e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  50 
 
 
309 aa  177  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  42.51 
 
 
206 aa  158  8e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  43.01 
 
 
188 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  42.11 
 
 
189 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  43.22 
 
 
195 aa  152  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  42.42 
 
 
190 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  42.19 
 
 
190 aa  149  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  42.19 
 
 
190 aa  149  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  44.04 
 
 
183 aa  148  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  41.88 
 
 
189 aa  148  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  44.44 
 
 
187 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  42.02 
 
 
184 aa  145  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  41.67 
 
 
188 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  42.31 
 
 
188 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  40.21 
 
 
188 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  41.49 
 
 
186 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  42.19 
 
 
187 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  41.41 
 
 
201 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  40.74 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  42.02 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  40.96 
 
 
186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  42.64 
 
 
195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  42.63 
 
 
187 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  42.54 
 
 
188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  38.02 
 
 
188 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  41.71 
 
 
186 aa  139  4.999999999999999e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  38.83 
 
 
192 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  40.21 
 
 
187 aa  138  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  42.71 
 
 
192 aa  139  6e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  41.36 
 
 
190 aa  138  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  41.03 
 
 
189 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  41.99 
 
 
188 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  36.98 
 
 
188 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  36.98 
 
 
188 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  38.83 
 
 
186 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  37.91 
 
 
190 aa  135  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.58 
 
 
198 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  40.96 
 
 
186 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  40.54 
 
 
186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  37.57 
 
 
187 aa  132  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  39.68 
 
 
187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  38.02 
 
 
187 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  38.83 
 
 
186 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  40.22 
 
 
191 aa  126  3e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  39.47 
 
 
180 aa  125  6e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  37.5 
 
 
188 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  36.41 
 
 
191 aa  122  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.24 
 
 
200 aa  122  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  39.36 
 
 
185 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  39.06 
 
 
187 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.04 
 
 
198 aa  116  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.33 
 
 
183 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  30.77 
 
 
305 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  34.95 
 
 
191 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  32.77 
 
 
299 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.57 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  32.09 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2988  nitrogen-fixing NifU domain protein  24.74 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  47.14 
 
 
74 aa  68.9  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  28.81 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1070  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.65 
 
 
76 aa  63.9  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.48 
 
 
81 aa  63.2  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.12 
 
 
294 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.12 
 
 
294 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  48 
 
 
75 aa  60.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1492  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.51 
 
 
109 aa  60.1  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0512001  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.07 
 
 
79 aa  60.1  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  44.44 
 
 
81 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  46.48 
 
 
74 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  39.33 
 
 
103 aa  58.9  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  51.56 
 
 
81 aa  58.5  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  48.44 
 
 
81 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.33 
 
 
87 aa  57.8  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  48.44 
 
 
81 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  48.44 
 
 
81 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.9 
 
 
74 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  48.44 
 
 
81 aa  57  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  43.21 
 
 
81 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  43.21 
 
 
81 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  43.21 
 
 
81 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  39.53 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  48.44 
 
 
81 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 
81 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2861  nitrogen-fixing NifU-like protein  40.62 
 
 
80 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.88 
 
 
72 aa  56.6  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  48.44 
 
 
78 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.15 
 
 
306 aa  56.2  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  43.75 
 
 
80 aa  55.8  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.88 
 
 
74 aa  55.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  43.75 
 
 
80 aa  55.8  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.62 
 
 
77 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.81 
 
 
291 aa  55.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.88 
 
 
79 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  48.44 
 
 
78 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.88 
 
 
79 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  48.44 
 
 
78 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  48.44 
 
 
78 aa  55.5  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>