56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_74722 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_74722  Glycoside hydrolase, family 17  100 
 
 
308 aa  628  1e-179  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154228  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10150  Putative beta-transglucosylase. Family GH17. A fumigatus Bgt1-like (Eurofung)  38.21 
 
 
304 aa  203  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.251061  normal  0.119691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  29.03 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  29.7 
 
 
558 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  30.11 
 
 
558 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  27.86 
 
 
536 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  31.33 
 
 
295 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  29.32 
 
 
541 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57025  cell wall glucanase Probable family 17 glucosidase SCW4 precursor (Soluble cell wall protein 4)  27.62 
 
 
303 aa  87.4  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277446  normal  0.953702 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 
889 aa  87  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  26.85 
 
 
541 aa  87  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 
868 aa  86.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07950  Beta-1,3-endoglucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUT0]  27.08 
 
 
465 aa  86.3  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000158341  normal  0.358394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  25.7 
 
 
869 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  29.21 
 
 
538 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  27.72 
 
 
494 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  28.29 
 
 
638 aa  83.2  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28554  Cell wall endo-beta-1,3-glucanase  23.62 
 
 
555 aa  83.2  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496398  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
889 aa  82.4  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  26.02 
 
 
895 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 
529 aa  79.3  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  26.54 
 
 
521 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 
919 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  23.33 
 
 
889 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  27.1 
 
 
521 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  22.61 
 
 
859 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  26.72 
 
 
522 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 
905 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  25.48 
 
 
540 aa  77.4  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  26.87 
 
 
532 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  23.99 
 
 
899 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  26.72 
 
 
525 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 
895 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32120  family 17 glucosidase SCW11 precursor (Soluble cell wall protein 11)  28.52 
 
 
452 aa  75.9  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.506951  normal  0.0756506 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 
903 aa  73.9  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  25.81 
 
 
863 aa  73.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 
531 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  22.73 
 
 
535 aa  72  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 
862 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  23.76 
 
 
863 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 
844 aa  70.5  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  22.3 
 
 
863 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  26.24 
 
 
533 aa  70.1  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  25.18 
 
 
650 aa  70.1  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
885 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03727  putative beta transglucosylase, GH17 family (Eurofung)  23.13 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  23.4 
 
 
863 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  22.26 
 
 
831 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  21.97 
 
 
944 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89695  Soluble Cell Wall protein  24.75 
 
 
369 aa  60.1  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.66 
 
 
842 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04700  Endo-beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B430]  26.07 
 
 
649 aa  55.8  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361112  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01551  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BD29]  24.64 
 
 
555 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.550208  normal  0.0387764 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00660  glucan 1,3 beta-glucosidase protein putative  23.55 
 
 
249 aa  52.4  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  21.09 
 
 
917 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0556  hypothetical protein  35.96 
 
 
620 aa  43.5  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>