More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_74533 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  64.07 
 
 
539 aa  711    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  63.7 
 
 
552 aa  703    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  100 
 
 
558 aa  1138    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  56.87 
 
 
534 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  56.87 
 
 
534 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  50.09 
 
 
546 aa  521  1e-146  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  36.01 
 
 
558 aa  303  5.000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  34 
 
 
543 aa  297  3e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  35.27 
 
 
554 aa  295  1e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  32.75 
 
 
555 aa  294  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  34.87 
 
 
553 aa  294  3e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  34.91 
 
 
554 aa  293  4e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  35.47 
 
 
539 aa  293  5e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  34.56 
 
 
560 aa  293  6e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  33.92 
 
 
559 aa  292  9e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  35.07 
 
 
558 aa  291  2e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  35.4 
 
 
545 aa  291  2e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  34.62 
 
 
553 aa  290  7e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  33.4 
 
 
551 aa  284  3.0000000000000004e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  34.71 
 
 
540 aa  281  3e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  31.56 
 
 
559 aa  280  4e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  34.26 
 
 
562 aa  278  2e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  31.72 
 
 
542 aa  278  3e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  32.64 
 
 
543 aa  277  4e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  35.33 
 
 
553 aa  277  4e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  33.27 
 
 
543 aa  276  8e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  34.14 
 
 
552 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  32.06 
 
 
557 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  33.07 
 
 
560 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  31.37 
 
 
558 aa  274  4.0000000000000004e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  32.59 
 
 
543 aa  273  7e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  32.22 
 
 
557 aa  272  9e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  35.07 
 
 
547 aa  272  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  31.71 
 
 
537 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  32.13 
 
 
545 aa  270  4e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  31.65 
 
 
547 aa  269  8e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  33.27 
 
 
551 aa  268  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  32.87 
 
 
551 aa  269  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  31.94 
 
 
542 aa  268  1e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  31.56 
 
 
563 aa  268  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  32.13 
 
 
542 aa  267  4e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  33.78 
 
 
548 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  30.91 
 
 
561 aa  266  8.999999999999999e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  30.6 
 
 
554 aa  263  8e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  32.87 
 
 
552 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  32.45 
 
 
552 aa  261  3e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  33.27 
 
 
550 aa  260  4e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  33.65 
 
 
554 aa  258  1e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  30.77 
 
 
570 aa  258  2e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  32.87 
 
 
500 aa  257  5e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  32.27 
 
 
553 aa  256  7e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  33.52 
 
 
549 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  33.08 
 
 
541 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  30.14 
 
 
553 aa  252  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  30.14 
 
 
553 aa  252  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  31.17 
 
 
548 aa  243  6e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  31.08 
 
 
530 aa  239  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  31.55 
 
 
558 aa  238  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.21 
 
 
536 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  29.1 
 
 
532 aa  231  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  29.76 
 
 
555 aa  231  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  31.06 
 
 
527 aa  230  6e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  28.38 
 
 
538 aa  229  7e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  28.12 
 
 
527 aa  229  1e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  29.78 
 
 
529 aa  223  9e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  27.02 
 
 
567 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  28.93 
 
 
535 aa  218  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  27.87 
 
 
525 aa  217  5e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  29.23 
 
 
536 aa  216  9e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  30.91 
 
 
550 aa  215  9.999999999999999e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  28.86 
 
 
546 aa  216  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  28.6 
 
 
542 aa  215  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  27.62 
 
 
558 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  28.19 
 
 
553 aa  213  4.9999999999999996e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  26.95 
 
 
559 aa  213  7e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  28.22 
 
 
519 aa  210  7e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  28.54 
 
 
528 aa  207  4e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  29.73 
 
 
536 aa  207  5e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  29.35 
 
 
527 aa  206  7e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  28.63 
 
 
568 aa  205  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  28.91 
 
 
535 aa  204  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  26.43 
 
 
560 aa  204  3e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  28.36 
 
 
541 aa  202  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  28.94 
 
 
548 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  28.17 
 
 
548 aa  197  5.000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  27.5 
 
 
525 aa  195  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  29.76 
 
 
529 aa  193  9e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  26.94 
 
 
528 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  27.84 
 
 
523 aa  190  7e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  28.57 
 
 
530 aa  189  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  26.4 
 
 
570 aa  188  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  28.33 
 
 
551 aa  187  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  28.99 
 
 
531 aa  187  5e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  27.79 
 
 
533 aa  187  5e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  28.44 
 
 
526 aa  184  3e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  27.08 
 
 
542 aa  183  7e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  24.73 
 
 
577 aa  180  5.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  25.32 
 
 
563 aa  177  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  27.17 
 
 
527 aa  166  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  25.89 
 
 
547 aa  157  7e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>