200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_72153 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_72153  NADPH-dependent methylglyoxal reductase GRE2  100 
 
 
337 aa  679    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00635585 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56762  protein induced by osmotic stress  51.94 
 
 
334 aa  336  3.9999999999999995e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.516497  normal  0.0996379 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58065  dihydroflavonol-4-reductases  50 
 
 
335 aa  330  2e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36555  Cinnamyl-alcohol dehydrogenase Flavonol reductase/cinnamoyl-CoA reductase  49.85 
 
 
339 aa  330  2e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0121063  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32463  protein induced by osmotic stress  48.66 
 
 
334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254213  normal  0.336313 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42452  dihydroflavonol-4-reductases  47.77 
 
 
336 aa  317  1e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34974  NADPH-dependent Cinnamyl-alcohol dehydrogenase.  45.21 
 
 
336 aa  301  7.000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.577054 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39216  GRE2-like protein  46.13 
 
 
335 aa  297  2e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239106  hitchhiker  0.00871069 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49223  protein induced by osmotic stress  46.13 
 
 
336 aa  290  2e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.376808 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05977  ketoreductase (AFU_orthologue; AFUA_2G10280)  38.17 
 
 
334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.396271 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03540  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  35 
 
 
346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03550  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  35.38 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03560  dihydrokaempferol 4-reductase, putative  34.46 
 
 
346 aa  171  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.44 
 
 
348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.621455 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.08 
 
 
346 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  33.52 
 
 
347 aa  160  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.403557 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.75 
 
 
348 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.33 
 
 
349 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.593459  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.24 
 
 
347 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00765  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02250)  33.33 
 
 
343 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.92 
 
 
346 aa  149  6e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.76 
 
 
346 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153396  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.64 
 
 
352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0529  dihydrokaempferol 4-reductase  32.17 
 
 
332 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31257  predicted protein  34.38 
 
 
354 aa  136  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.367524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.33 
 
 
341 aa  135  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.33 
 
 
341 aa  135  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34417  hypothetical protein  32.99 
 
 
328 aa  129  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.584917  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80185  CAD family protein  32.86 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101414  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2413  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 
352 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208408  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56924  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 
332 aa  125  9e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.302956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  31.47 
 
 
340 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01830  oxidoreductase, putative  29.12 
 
 
357 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 
342 aa  122  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
341 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.558578  normal  0.0371472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.45 
 
 
325 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 
351 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249443  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50500  predicted protein  30.88 
 
 
358 aa  113  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.650002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
347 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0426426  normal  0.159992 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6522  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.46 
 
 
363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5668  dihydrokaempferol 4-reductase  33.46 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6032  dihydrokaempferol 4-reductase  33.46 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
332 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31128  cinnamoyl-Coa reductase  28.65 
 
 
328 aa  107  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
357 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5780  dihydrokaempferol 4-reductase  32.32 
 
 
357 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42555 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
355 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0378933  normal  0.767388 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5234  hypothetical protein  28.72 
 
 
349 aa  99.8  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08583  aldehyde reductase II (AFU_orthologue; AFUA_1G11360)  28.76 
 
 
341 aa  98.2  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.835406  normal  0.302961 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15511  dihydroflavonol-4-reductase  29.41 
 
 
322 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.738069  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 
342 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  28.62 
 
 
349 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.54 
 
 
352 aa  84  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  29.93 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  29.93 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.1 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37466  predicted protein  31.65 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  29.73 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 
339 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  27.14 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
328 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.64 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 
358 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  26.98 
 
 
340 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  26.73 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
355 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0240  dihydroflavonol 4-reductase family protein  29.39 
 
 
329 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00224634  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  26.84 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
313 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  27.05 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.21 
 
 
334 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  26.2 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
333 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.956027  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  24.66 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 
361 aa  60.8  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  26.47 
 
 
335 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  26.84 
 
 
335 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.99 
 
 
335 aa  60.5  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 
339 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.8 
 
 
327 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
354 aa  60.1  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0848085  normal  0.577467 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  26.33 
 
 
329 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.9 
 
 
329 aa  59.7  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  26.62 
 
 
329 aa  59.7  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  25.83 
 
 
336 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>