More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_68764 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  100 
 
 
640 aa  1319    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  43.2 
 
 
700 aa  496  1e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  41.27 
 
 
798 aa  463  1e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04320  conserved hypothetical protein  43.15 
 
 
668 aa  432  1e-120  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.931414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  39.59 
 
 
537 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  39.72 
 
 
545 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  42.29 
 
 
532 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  41.03 
 
 
531 aa  405  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  40.69 
 
 
539 aa  402  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  38.51 
 
 
537 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  39.05 
 
 
542 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  40.41 
 
 
602 aa  392  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  36.93 
 
 
546 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  38.24 
 
 
548 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  36.75 
 
 
516 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.26 
 
 
530 aa  349  9e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  36.94 
 
 
519 aa  346  8.999999999999999e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  36.25 
 
 
519 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  36.72 
 
 
519 aa  337  5e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 
525 aa  336  7e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  36.86 
 
 
528 aa  330  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.35 
 
 
525 aa  329  9e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  35.84 
 
 
566 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  35.8 
 
 
529 aa  327  6e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  36.68 
 
 
533 aa  323  9.000000000000001e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  38.94 
 
 
536 aa  322  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  35.49 
 
 
518 aa  318  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  35.8 
 
 
517 aa  317  6e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  35.37 
 
 
543 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 
532 aa  314  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  37.39 
 
 
532 aa  311  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 
546 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  35.41 
 
 
543 aa  308  3e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 
534 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  35.07 
 
 
540 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 
524 aa  299  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_1129  predicted protein  35.34 
 
 
562 aa  293  6e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 
552 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  35.12 
 
 
520 aa  280  4e-74  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0499  glycerol-3-phosphate oxidase  34.12 
 
 
525 aa  259  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717318  normal  0.0321239 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1836  putative glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.15 
 
 
529 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.399827  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 
574 aa  251  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.92 
 
 
585 aa  248  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  37.69 
 
 
520 aa  247  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 
556 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.09 
 
 
557 aa  243  9e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 
543 aa  241  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.02 
 
 
557 aa  239  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.02 
 
 
573 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 
582 aa  235  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.65 
 
 
591 aa  233  6e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 
603 aa  233  9e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 
639 aa  232  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  31.32 
 
 
578 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 
600 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  30 
 
 
543 aa  229  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 
554 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 
579 aa  228  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 
584 aa  228  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 
583 aa  227  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 
577 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.96 
 
 
567 aa  226  8e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 
574 aa  225  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  30.78 
 
 
569 aa  224  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
575 aa  223  8e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 
579 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 
582 aa  221  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 
579 aa  221  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  32.24 
 
 
585 aa  220  7e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 
603 aa  219  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 
567 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 
557 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0808  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
560 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000105669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 
552 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 
582 aa  213  9e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
573 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 
562 aa  211  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 
573 aa  211  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.43 
 
 
554 aa  211  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 
557 aa  211  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 
579 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 
572 aa  210  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  29.42 
 
 
560 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000427543  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  33.2 
 
 
579 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  33.2 
 
 
579 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.68 
 
 
587 aa  208  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 
568 aa  208  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 
559 aa  207  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  29.03 
 
 
560 aa  206  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000204459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  29.03 
 
 
560 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405869  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.26 
 
 
502 aa  206  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 
581 aa  206  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.85 
 
 
560 aa  205  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000453053  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  30.49 
 
 
559 aa  205  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  28.85 
 
 
560 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.85 
 
 
560 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  28.85 
 
 
560 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  28.85 
 
 
560 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2576  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 
508 aa  203  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4232  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  29.03 
 
 
560 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159546  hitchhiker  0.000000074562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>