More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_64926 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_64926  pyruvate decarboxylase  100 
 
 
596 aa  1226    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.99262  normal  0.284292 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86443  pyruvate decarboxylase  68.79 
 
 
570 aa  842    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04888  Pyruvate decarboxylase (EC 4.1.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P87208]  46.22 
 
 
568 aa  525  1e-148  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0997848  normal  0.116699 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00950  pyruvate decarboxylase, putative  41.51 
 
 
713 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08396  pyruvate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00750)  36.64 
 
 
575 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2232  indolepyruvate decarboxylase  35.19 
 
 
561 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224159  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2440  putative indolepyruvate decarboxylase  35.48 
 
 
558 aa  363  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00745629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2311  indolepyruvate decarboxylase  35.23 
 
 
561 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2486  indolepyruvate decarboxylase  35.23 
 
 
561 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00246816  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3412  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.59 
 
 
553 aa  360  5e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2279  indolepyruvate decarboxylase  35.31 
 
 
561 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000128489  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2507  putative indolepyruvate decarboxylase  35.14 
 
 
558 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2517  indolepyruvate decarboxylase, putative  35.14 
 
 
561 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000921209  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3426  indolepyruvate decarboxylase  35.06 
 
 
555 aa  355  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.310622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2581  putative indolepyruvate decarboxylase  34.24 
 
 
558 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000225581  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2242  indole-3-pyruvate decarboxylase  35.18 
 
 
549 aa  343  7e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2923  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.5 
 
 
552 aa  342  9e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.356965  normal  0.0604993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2663  indole-3-pyruvate decarboxylase  35.33 
 
 
550 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.603651 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2597  indole-3-pyruvate decarboxylase  35.16 
 
 
550 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.380997  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2548  indole-3-pyruvate decarboxylase  34.99 
 
 
550 aa  336  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581828  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10870  pyruvate or indole-3-pyruvate decarboxylase pdc  34.83 
 
 
560 aa  336  7.999999999999999e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0234089 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2639  indole-3-pyruvate decarboxylase  35.1 
 
 
550 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2362  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.12 
 
 
553 aa  328  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0178  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.99 
 
 
546 aa  328  3e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0173  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.99 
 
 
546 aa  328  3e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2434  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.3 
 
 
572 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118986  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0109  putative pyruvate decarboxylase  31.58 
 
 
580 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731177  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1429  indolepyruvate decarboxylase  33.33 
 
 
542 aa  318  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0493266 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0964  pyruvate decarboxylase  32.67 
 
 
556 aa  316  9e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.719154  unclonable  0.0000449891 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0858  putative pyruvate decarboxylase  32.72 
 
 
556 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.434282  normal  0.563377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.33 
 
 
558 aa  313  6.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0182  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.48 
 
 
561 aa  310  5.9999999999999995e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.217855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4879  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.31 
 
 
546 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2156  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.42 
 
 
552 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2218  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.42 
 
 
552 aa  294  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4795  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.39 
 
 
554 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.781269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1794  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.33 
 
 
547 aa  290  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  0.90828 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0838  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.2 
 
 
576 aa  259  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00172744  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2390  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.66 
 
 
550 aa  254  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.517187  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1571  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.26 
 
 
545 aa  240  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3389  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.29 
 
 
562 aa  236  8e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.887563  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62095  pyruvate decarboxylase (PDC6) (PDC3)  29.01 
 
 
623 aa  236  1.0000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.732507  normal  0.466164 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1157  hypothetical protein  28.55 
 
 
559 aa  230  6e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1162  hypothetical protein  28.71 
 
 
559 aa  229  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0887  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.14 
 
 
557 aa  223  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0996  thiamine pyrophosphate enzyme family decarboxylase  28.12 
 
 
549 aa  209  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.604603  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2858  pyruvate decarboxylase  25.98 
 
 
547 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2242  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.29 
 
 
558 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4114  thiamine pyrophosphate enzyme  27.04 
 
 
541 aa  183  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.178401 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.29 
 
 
551 aa  172  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0792937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3526  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  26.66 
 
 
543 aa  170  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0476584  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2425  indole-3-pyruvate decarboxylase  27.06 
 
 
543 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3836  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.59 
 
 
586 aa  165  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.742198  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3027  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  26.58 
 
 
543 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.306897  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0512  indole-3-pyruvate decarboxylase  25.69 
 
 
545 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2896  indole-3-pyruvate decarboxylase (Indolepyruvatedecarboxylase)  35.19 
 
 
274 aa  156  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal  0.207962 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0101  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  23.13 
 
 
542 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438272  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2719  phenylpyruvate decarboxylase  23.43 
 
 
553 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0518  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding protein  24.01 
 
 
540 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1754  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  23.42 
 
 
572 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2331  putative phenylpyruvate decarboxylase  21.55 
 
 
555 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00138899  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1613  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.32 
 
 
558 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.48 
 
 
561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.33 
 
 
556 aa  110  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.33 
 
 
561 aa  110  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.33 
 
 
581 aa  110  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  23.69 
 
 
566 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.14 
 
 
581 aa  108  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.87 
 
 
563 aa  107  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.24 
 
 
566 aa  103  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.64 
 
 
563 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  23.14 
 
 
547 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.65 
 
 
568 aa  102  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  24.06 
 
 
547 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  24.06 
 
 
547 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  24.06 
 
 
547 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  23.33 
 
 
547 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  22.94 
 
 
556 aa  101  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3360  acetolactate synthase  23.95 
 
 
552 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  23.37 
 
 
555 aa  100  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1428  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.68 
 
 
564 aa  100  7e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00100174  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.64 
 
 
554 aa  100  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  24.9 
 
 
567 aa  100  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  23.29 
 
 
547 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  23.33 
 
 
547 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  23.52 
 
 
562 aa  99.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  24.22 
 
 
566 aa  99  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  23.33 
 
 
547 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.84 
 
 
565 aa  97.8  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.24 
 
 
561 aa  97.8  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.1 
 
 
565 aa  97.4  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  23.21 
 
 
547 aa  97.1  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  22.87 
 
 
547 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.84 
 
 
562 aa  97.1  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.34 
 
 
561 aa  96.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.05 
 
 
535 aa  95.9  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0816  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.19 
 
 
558 aa  95.9  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1763  acetolactate synthase, large subunit  21.66 
 
 
547 aa  95.5  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2037  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.1 
 
 
564 aa  95.5  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182642  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  22.87 
 
 
550 aa  95.1  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>