47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_63621 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  100 
 
 		 88 aa  180  6e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10007  U6 small nuclear ribonucleoprotein (Lsm3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12570)  58.82 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42364  predicted protein  51.81 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0179041  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43771  predicted protein  44.09 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07590  Sm-like protein, putative  48.86 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  45.33 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  46.67 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  50 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  46.05 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  42.67 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  50.77 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  46.05 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  42.86 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  43.24 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  46.15 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  42.11 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  44.74 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  44.44 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42488  predicted protein  42.11 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.357284  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2924  Like-Sm ribonucleoprotein core  43.24 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  38.46 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  42.86 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8840  predicted protein  42.65 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.741263  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.27 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0290  like-Sm ribonucleoprotein core  38.67 
 
 		 71 aa  50.4  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  41.94 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  43.55 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00767  small nuclear ribonucleoprotein (LSM7), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14290)  35.06 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10583  predicted protein  32 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329173  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03050  pre-mRNA splicing factor, putative  37.5 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.03026  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2097  Like-Sm ribonucleoprotein core  35.62 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.765143 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1521  like-Sm ribonucleoprotein core  37.84 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0711074  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0437  like-Sm ribonucleoprotein, core  37.84 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0398  like-Sm ribonucleoprotein core  37.84 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0470  like-Sm ribonucleoprotein core  37.84 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31317  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1066  Like-Sm ribonucleoprotein core  36.25 
 
 		 287 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35794  predicted protein  34.78 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  34.25 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0736  like-Sm ribonucleoprotein, core  31.51 
 
 		 100 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0227658  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  35.29 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46810  predicted protein  32.95 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.200547 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0674  Like-Sm ribonucleoprotein core  36.54 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.973126  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1181  Like-Sm ribonucleoprotein core  32.05 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00764274  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  31.33 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0866  like-Sm ribonucleoprotein core  31.4 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32889  predicted protein  34.29 
 
 		 97 aa  40  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  28.21 
 
 		 87 aa  40  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00778138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>