More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_61490 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_61490  DRAP deaminase and pseudouridylate synthase  100 
 
 		 425 aa  887    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33477  DRAP deaminase  36.08 
 
 		 585 aa  188  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.261571 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10936  DRAP deaminase (Rib2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16360)  28.63 
 
 		 572 aa  177  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292006 
 
 
-
 
NC_006686  CND02470  conserved hypothetical protein  34.41 
 
 		 520 aa  163  6e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0281406  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14067  predicted protein  33.56 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.952518  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4215  predicted protein  26.23 
 
 		 357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4308  pseudouridine synthase, RluA family  34.08 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4953  pseudouridine synthase, RluA family  31.65 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4177  pseudouridine synthase, RluD  34.09 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.463318  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4321  RluA family pseudouridine synthase  33.33 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.412069 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8859  predicted protein  32.14 
 
 		 168 aa  107  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00776718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4330  pseudouridine synthase, RluA family  31.98 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2588  pseudouridine synthase, RluA family  35.48 
 
 		 325 aa  107  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0023  putative ribosomal pseudouridine synthase  34.86 
 
 		 300 aa  105  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.835317  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1517  RluA family pseudouridine synthase  30.57 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000147946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1482  RluA family pseudouridine synthase  30.36 
 
 		 333 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3808  RluA family pseudouridine synthase  29.96 
 
 		 333 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0127606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1413  pseudouridine synthase, RluA family  34.66 
 
 		 293 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0119542  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1955  tRNA pseudouridine synthase C  27.68 
 
 		 246 aa  100  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419985 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0049  RNA pseudouridine synthase family protein  34.24 
 
 		 300 aa  99.8  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0024  RNA pseudouridine synthase family protein  33.7 
 
 		 300 aa  99.8  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14830  Pseudouridine synthase, RluC  28.93 
 
 		 278 aa  99.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.300608  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  32.83 
 
 		 306 aa  99  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0318  RluA  35.23 
 
 		 299 aa  98.6  2e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264747  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3127  pseudouridine synthase, RluA family  29.33 
 
 		 327 aa  98.6  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0022  RNA pseudouridylate synthase family protein  32.6 
 
 		 300 aa  97.8  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2303  RluA family pseudouridine synthase  30.41 
 
 		 323 aa  97.4  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2006  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.28 
 
 		 334 aa  97.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1620  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.98 
 
 		 332 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00181118  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  28.72 
 
 		 623 aa  96.7  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0213  pseudouridine synthase  32.04 
 
 		 240 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0138576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2274  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.18 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1825  pseudouridine synthase  33.85 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  29.33 
 
 		 311 aa  94.7  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  28.85 
 
 		 311 aa  94.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31 
 
 		 300 aa  94  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2439  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  26.33 
 
 		 338 aa  94.4  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.122309  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.5 
 
 		 300 aa  94  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25580  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.39 
 
 		 318 aa  94  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050794  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3840  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.87 
 
 		 318 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.283554  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5026  RluA family pseudouridine synthase  30.96 
 
 		 356 aa  93.6  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.257508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0315  pseudouridine synthase  32.11 
 
 		 264 aa  93.2  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1479  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.29 
 
 		 316 aa  93.2  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3343  pseudouridine synthase, RluA family  28.41 
 
 		 341 aa  93.2  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0105982 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1589  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.79 
 
 		 308 aa  93.2  9e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0462053  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0596  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.34 
 
 		 308 aa  92.8  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000579613  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3146  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.06 
 
 		 343 aa  92.8  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  32.65 
 
 		 306 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.14 
 
 		 296 aa  92.4  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  30.39 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.41 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268386  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1431  pseudouridine synthase, RluA family  32.51 
 
 		 289 aa  92  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2906  pseudouridine synthase  27.43 
 
 		 303 aa  92  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  32.14 
 
 		 306 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1014  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  33.83 
 
 		 304 aa  92  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000716198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3519  pseudouridine synthase  25.94 
 
 		 234 aa  92  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.108825 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0069  pseudouridine synthase  32 
 
 		 235 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1162  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.16 
 
 		 276 aa  91.3  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0658766  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0056  pseudouridine synthase  31.12 
 
 		 302 aa  91.3  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1976  pseudouridine synthase, RluD  30.85 
 
 		 318 aa  91.3  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22770  pseudouridine synthase, RluA family  26.67 
 
 		 318 aa  90.9  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191328  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1639  pseudouridine synthase, RluD  28.87 
 
 		 318 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.289887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  31.98 
 
 		 305 aa  90.9  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1102  RluA family pseudouridine synthase  29.22 
 
 		 314 aa  90.9  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2503  RluA family pseudouridine synthase  30.21 
 
 		 319 aa  90.5  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.721496  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08290  pseudouridine synthase, RluA family  33.71 
 
 		 310 aa  90.5  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2094  pseudouridine synthase, RluD  31.28 
 
 		 304 aa  90.5  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2314  pseudouridine synthase, RluD  32.81 
 
 		 334 aa  90.1  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.651442  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  31.25 
 
 		 331 aa  90.1  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2882  RluA family pseudouridine synthase  30.84 
 
 		 300 aa  90.1  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.01 
 
 		 301 aa  90.1  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3719  RluA family pseudouridine synthase  32.62 
 
 		 302 aa  89.7  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00132143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3993  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  33.16 
 
 		 302 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000288046  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1288  RluA family pseudouridine synthase  31.65 
 
 		 285 aa  89.7  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.543506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3518  pseudouridine synthase, RluA family  30.81 
 
 		 299 aa  89.7  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0984  pseudouridine synthase, RluA family  30.32 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0148654  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2937  pseudouridine synthase  28.96 
 
 		 302 aa  89.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.519419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0291  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.15 
 
 		 348 aa  89.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2133  RluA family pseudouridine synthase  28.16 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0787  pseudouridine synthase  32.78 
 
 		 281 aa  89.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1594  RluA family pseudouridine synthase  27.75 
 
 		 329 aa  89.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0260553  normal  0.0130241 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0680  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  32.74 
 
 		 299 aa  89.4  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1248  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  33.16 
 
 		 302 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000362529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4020  pseudouridine synthase, RluA family  30.63 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1604  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34 
 
 		 318 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2719  RluA family pseudouridine synthase  30.37 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.344852  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4165  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.57 
 
 		 320 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0336491  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1893  disulfide isomerase  29.41 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0591  RluA family pseudouridine synthase  28.39 
 
 		 322 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0464018 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.1 
 
 		 303 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3978  pseudouridine synthase, RluA family  30.63 
 
 		 306 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2566  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.96 
 
 		 329 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00643292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1988  pseudouridylate synthase  31.43 
 
 		 330 aa  88.6  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00771455  normal  0.0114075 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  27.48 
 
 		 303 aa  87.8  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0059  RluA family pseudouridine synthase  27.27 
 
 		 339 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14313 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3937  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.62 
 
 		 302 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000762664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3651  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  32.62 
 
 		 302 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169242  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1813  pseudouridine synthase, RluA family  31.38 
 
 		 303 aa  87.8  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1353  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.2 
 
 		 403 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270637  normal  0.743014 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3944  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  32.62 
 
 		 302 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>